目的 分析2002-2010年浙江省急性出血性结膜炎(AHC)暴发疫情病原柯萨奇病毒A组24型变种(CA24v)流行株的全基因组序列与遗传特性.方法 选取浙江省不同年份的CA24v流行株,采用RT-PCR扩增基因序列,并与国内外流行株进行全基因组及VP1、3C区序列比较分析.结果 浙江省2002年和2010年CA24v全序列为7456～ 7458 bp,编码含2214个氨基酸残基的多聚蛋白,2010年的Zhejiang/08/10较2002年的毒株在5’端非编码区的第97、119位各存在一个T碱基插入,Zhejiang/08/10与2002年以来的分离株各区段氨基酸同源性为94.7％～ 100.0％,与近60年来CA24流行代表株全序列中各区段氨基酸的平均差异率以2A区与3A区最大,分别达8.4％和7.3％,3D区最小,仅为1.9％.1987年与2002年以来的CA24v毒株在全序列上共存在38个和20个氨基酸的稳定变异.2002-2010年CA24v的组间遗传距离分析表明,3C区较VP1区更为稳定,CA24v的早年流行株Jamaica/10628/87在3D区上可能存在重组,而在近年流行株中未发现该现象.结论 CA24v以时间序列为主逐年进化,地域间虽存在差异,但影响较小.自2002年起,由CA24v引起的AHC-直在浙江省本地散在流行.
作者：李焕；徐昌平；严菊英；卢亦愚；金青青；冯燕；莫世华
来源：中华流行病学杂志 2013 年 34卷 5期
