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目的 筛选乙型肝炎肝硬化合并肝癌患者肝癌组织与肝硬化组织微小RNA(miRNA)差异表达谱,为研究miRNA在肝细胞癌变机制中的作用提供基础.方法 选取2013年1-4月于新疆医科大学第一附属医院行肝癌根治治疗的慢性乙型肝炎肝硬化合并肝癌患者9例.利用Trizol法提取肝癌组织和配对的肝硬化组织细胞中的总RNA,分光光度计NanoDropND-1000进行定量,变性凝胶电泳分析提取总RNA质量.利用芯片技术对提取的RNA经miRNA芯片进行杂交,结果经扫描读数,Significance Analysis of Microarrays 3.02软件挑选差异表达基因,实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(PCR)验证芯片的结果.结果 肝癌组和肝硬化组中共筛选出15个差异表达的miRNA,其中有7个基因在肝癌中上调表达,分别为hsa-miR-1269,hsa-miR-18a,hsa-miR-1180,hsa-miR-1301,hsa-miR-182,hsa-miR-222,hsa-miR-3626p;8个基因在肝癌中表达下调,分别为hsa-miR-99a,hsa-miR-10a,hsa-miR-30a,hsa-miR-30e,hsa-miR-139-5p,hsa-miR-422a,hsa-miR-199a-3p,hsa-miR-199b-3p.实时荧光定量逆转录PCR验证结果显示,上调表达基因miR-1269在肝癌组和肝硬化组中的平均表达丰度分别为12.1±4.0和16.7±2.4,差异有统计学意义(P=0.0l0).下调表达基因miR-199b-3p在肝癌组和肝硬化组中的平均表达丰度分

作者:范晓棠;张建庆;马海林;石绣江;冯娟;何方平

来源:中国医药 2017 年 12卷 8期

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作者:
范晓棠;张建庆;马海林;石绣江;冯娟;何方平
来源:
中国医药 2017 年 12卷 8期
标签:
肝细胞癌 肝硬化 微小RNA芯片 基因表达 Hepatocellular carcinoma Liver cirrhosis MicroRNA microarray Gene expression
目的 筛选乙型肝炎肝硬化合并肝癌患者肝癌组织与肝硬化组织微小RNA(miRNA)差异表达谱,为研究miRNA在肝细胞癌变机制中的作用提供基础.方法 选取2013年1-4月于新疆医科大学第一附属医院行肝癌根治治疗的慢性乙型肝炎肝硬化合并肝癌患者9例.利用Trizol法提取肝癌组织和配对的肝硬化组织细胞中的总RNA,分光光度计NanoDropND-1000进行定量,变性凝胶电泳分析提取总RNA质量.利用芯片技术对提取的RNA经miRNA芯片进行杂交,结果经扫描读数,Significance Analysis of Microarrays 3.02软件挑选差异表达基因,实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(PCR)验证芯片的结果.结果 肝癌组和肝硬化组中共筛选出15个差异表达的miRNA,其中有7个基因在肝癌中上调表达,分别为hsa-miR-1269,hsa-miR-18a,hsa-miR-1180,hsa-miR-1301,hsa-miR-182,hsa-miR-222,hsa-miR-3626p;8个基因在肝癌中表达下调,分别为hsa-miR-99a,hsa-miR-10a,hsa-miR-30a,hsa-miR-30e,hsa-miR-139-5p,hsa-miR-422a,hsa-miR-199a-3p,hsa-miR-199b-3p.实时荧光定量逆转录PCR验证结果显示,上调表达基因miR-1269在肝癌组和肝硬化组中的平均表达丰度分别为12.1±4.0和16.7±2.4,差异有统计学意义(P=0.0l0).下调表达基因miR-199b-3p在肝癌组和肝硬化组中的平均表达丰度分