目的 筛选小鼠支气管肺发育不良(BPD)相关的潜在关键基因.方法 从基因表达综合(GEO)数据库中获取BPD小鼠GSE25286和GSE29632数据集,筛选出2个数据集中共同的差异基因.通过基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析上述差异基因的生物学作用.利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI),利用Cytoscape3.7.2的CytoHubba插件筛选PPI网络中关键基因,再利用clusterProfiler包的关键基因进行GO和KEGG分析.结果 GSE25286和GSE29632数据集中共筛选出45个共同差异基因.GO富集分析表明差异基因主要富集于受体配体活性、细胞因子活性、生长因子活性、趋化因子活性、受体复合物、质膜受体复合体等,KEGG结果显示差异基因主要富集于细胞因子受体相互作用、磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶B信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、p53信号通路、缺氧诱导因子1信号通路等.在PPI网络中筛选出7个关键基因:分别为早期生长反应1、细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子1A、丝氨酸蛋白酶抑制因子1、生长分化因子15、细胞因子信号传导抑制因子3、血小板反应蛋白1、抑瘤素M受体基因.结论 BPD的生物信息学分析可发现相关潜在关键基因,可能为探索BPD潜在发病机制和治疗靶点提供理论依据.
作者：成小蓉；姜军；吴大珍；莫连芹；黄栋
来源：中国医药 2022 年 17卷 9期
