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目的:通过生物信息学分析探讨膜性肾病(MN)中有关M2巨噬细胞的免疫分子机制。方法:从基因表达集(GEO)数据库下载微阵列数据集(GSE104948和GSE108109,其中GSE108109作为验证数据集),使用Timer数据库进行免疫浸润分析。以M2巨噬细胞作为表型进行加权基因共表达网络分析,筛选M2巨噬细胞相关核心基因。从差异表达基因和核心基因的交集确定潜在关键基因。利用数据集GSE108109验证潜在关键基因的表达水平,以接受者操作特征(ROC)曲线分析评估其诊断价值。结果:M2巨噬细胞在MN组和正常对照组之间显著不同。确定了6个M2巨噬细胞相关的关键基因:PPARGC1A、ESRRG、KCNJ16、HLF、HGD和SULT1C2。ROC曲线分析显示,以上6个基因的ROC曲线下面积值均大于0.85。结论:本研究发现了有关MN中M2巨噬细胞的6个基因,尚需进一步研究验证其在MN中的作用。

作者:吴琼;朱国贞

来源:中华肾病研究电子杂志 2023 年 12卷 3期

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作者:
吴琼;朱国贞
来源:
中华肾病研究电子杂志 2023 年 12卷 3期
标签:
膜性肾病 免疫细胞浸润 M2巨噬细胞 生物信息学分析 关键基因
目的:通过生物信息学分析探讨膜性肾病(MN)中有关M2巨噬细胞的免疫分子机制。方法:从基因表达集(GEO)数据库下载微阵列数据集(GSE104948和GSE108109,其中GSE108109作为验证数据集),使用Timer数据库进行免疫浸润分析。以M2巨噬细胞作为表型进行加权基因共表达网络分析,筛选M2巨噬细胞相关核心基因。从差异表达基因和核心基因的交集确定潜在关键基因。利用数据集GSE108109验证潜在关键基因的表达水平,以接受者操作特征(ROC)曲线分析评估其诊断价值。结果:M2巨噬细胞在MN组和正常对照组之间显著不同。确定了6个M2巨噬细胞相关的关键基因:PPARGC1A、ESRRG、KCNJ16、HLF、HGD和SULT1C2。ROC曲线分析显示,以上6个基因的ROC曲线下面积值均大于0.85。结论:本研究发现了有关MN中M2巨噬细胞的6个基因,尚需进一步研究验证其在MN中的作用。