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目的 应用同位素标记相对和绝对定量蛋白质组学技术(iTRAQ)筛选胚胎发育不良性神经上皮肿瘤(DNT)差异表达蛋白.方法 将DNT实体组织标本(2例)与正常脑组织标本(2例),各组标本混合后提取蛋白,进行定量和酶解.iTRAQ标记后进行液相串联质谱分析.通过Mascot软件进行图谱分析.结果 实验匹配到的谱图数量是82 300张,其中特有谱图数量为57 738张,共鉴定到2 663个蛋白,16 341个肽段,其中含14 993个特有肽段.当蛋白丰度差异倍数达到1.3倍以上,且经统计检验其P值小于0.05时,视为差异蛋白,共鉴定差异蛋白225个,其中48个蛋白上调,177个蛋白下调.结论 通过iTRAQ技术分析得到的DNT差异表达蛋白可靠,iTRAQ技术为筛选出有意义的DNT生物标记物提供了一个良好的平台.

作者:廖秋林;张伟;彭大云;王蔚;张海燕;陈晓东

来源:中华神经外科疾病研究杂志 2016 年 15卷 6期

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作者:
廖秋林;张伟;彭大云;王蔚;张海燕;陈晓东
来源:
中华神经外科疾病研究杂志 2016 年 15卷 6期
标签:
胚胎发育不良性神经上皮肿瘤 蛋白质组学 同位素标记相对和绝对定量技术 生物标记物 Dysembryoplastic neuroepithelial tumor (DNT) Proteomics Isobaric tags for relative and absolute quantitation (iTRAQ) Biomarker
目的 应用同位素标记相对和绝对定量蛋白质组学技术(iTRAQ)筛选胚胎发育不良性神经上皮肿瘤(DNT)差异表达蛋白.方法 将DNT实体组织标本(2例)与正常脑组织标本(2例),各组标本混合后提取蛋白,进行定量和酶解.iTRAQ标记后进行液相串联质谱分析.通过Mascot软件进行图谱分析.结果 实验匹配到的谱图数量是82 300张,其中特有谱图数量为57 738张,共鉴定到2 663个蛋白,16 341个肽段,其中含14 993个特有肽段.当蛋白丰度差异倍数达到1.3倍以上,且经统计检验其P值小于0.05时,视为差异蛋白,共鉴定差异蛋白225个,其中48个蛋白上调,177个蛋白下调.结论 通过iTRAQ技术分析得到的DNT差异表达蛋白可靠,iTRAQ技术为筛选出有意义的DNT生物标记物提供了一个良好的平台.