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目的 胶质母细胞瘤(GBM)的胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤(CpG)岛岸区(GCI shores)甲基化改变较CpG岛甲基化改变频率更高,但是其与GBM的关系目前尚不清楚.方法 利用肿瘤与癌症基因图谱计划(TCGA),基因表达公共数据库(GEO)中GSE36278和GSE60274系列中的GBM病例资料和芯片数据,通过Cox回归模型与生存分析,研究GCI shores甲基化状态与GBM患者预后的关系.结果 TCGA病例组(n=136)中高风险组的中位OS为8.1个月[95%可信区间(CI):5.8 ~10.5个月],短于低风险组的中位OS为20.1个月(95% CI:17.4~22.8个月),P<0.001;GSE36278病例组(n=37)中高风险组的中位OS为12个月(95% CI:11.5~ 12.5个月),短于低风险组的中位OS 15个月(95% CI:12.4~17.6个月),P=0.023;验证组GSE60274病例组(n=62)中高风险组的中位OS为10.5个月(95% CI:7.8~13.1个月),短于低风险组的中位OS 16.0个月(95% CI:14.3~17.7个月),P=0.003;多因素Cox回归分析表明7-GCI shores甲基化状态评分是独立于O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)启动子甲基化状态和年龄的预后因素.结论 本研究首次建立并验证了可以预测GBM患者临床预后的基于7-GCI shores区域甲基化状态的风险评分方程.

作者:康恩铭;章薇;章翔

来源:中华神经外科疾病研究杂志 2018 年 17卷 1期

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作者:
康恩铭;章薇;章翔
来源:
中华神经外科疾病研究杂志 2018 年 17卷 1期
标签:
胶质母细胞瘤 DNA甲基化 基因芯片 预后分析 Glioblastoma DNA methylation Gene expression microarray Prognosis
目的 胶质母细胞瘤(GBM)的胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤(CpG)岛岸区(GCI shores)甲基化改变较CpG岛甲基化改变频率更高,但是其与GBM的关系目前尚不清楚.方法 利用肿瘤与癌症基因图谱计划(TCGA),基因表达公共数据库(GEO)中GSE36278和GSE60274系列中的GBM病例资料和芯片数据,通过Cox回归模型与生存分析,研究GCI shores甲基化状态与GBM患者预后的关系.结果 TCGA病例组(n=136)中高风险组的中位OS为8.1个月[95%可信区间(CI):5.8 ~10.5个月],短于低风险组的中位OS为20.1个月(95% CI:17.4~22.8个月),P<0.001;GSE36278病例组(n=37)中高风险组的中位OS为12个月(95% CI:11.5~ 12.5个月),短于低风险组的中位OS 15个月(95% CI:12.4~17.6个月),P=0.023;验证组GSE60274病例组(n=62)中高风险组的中位OS为10.5个月(95% CI:7.8~13.1个月),短于低风险组的中位OS 16.0个月(95% CI:14.3~17.7个月),P=0.003;多因素Cox回归分析表明7-GCI shores甲基化状态评分是独立于O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)启动子甲基化状态和年龄的预后因素.结论 本研究首次建立并验证了可以预测GBM患者临床预后的基于7-GCI shores区域甲基化状态的风险评分方程.