目的采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测我国广东、福建地区2000~2001年手足口病(HFMD)散发病例中的肠道病毒71型(EV71),进而通过扩增VP1节段的核苷酸序列,进行毒株的种系进化分析. 方法以肠道病毒特异引物对EV-1、EV-2进行RT-PCR,经琼脂糖凝胶电泳鉴定为阳性的标本,进一步用EV71特异引物对159S、162A进行RT-PCR,扩增的VP1节段经纯化后与测序载体pGEM-T连接,转化大肠埃希菌DH5α,筛选后测序.所得序列与我国深圳、上海、武汉地区的EV71流行株,中国台湾1998年4例HFMD暴发分离的EV71毒株,及来自美国、日本、匈牙利等国家地区的EV71毒株的核苷酸序列,用ClustalX 1.8和PHYLIP 3.5进行比对分析,构建种系进化树. 结果 25份标本检测EV71的阳性率为20
作者:林思恩;章青;谢华萍;谢健萍;何家鑫;董巧丽;方肇寅
来源:中华实验和临床病毒学杂志 2004 年 18卷 3期