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目的 分析甲型肝炎减毒活疫苗H2株(hepatitis A virus H2 live attenuated vaccine strain)毒种H2M20K7(K7)经连续传代后病毒基因的遗传稳定性.方法 将H2株毒种K7用细胞工厂在人二倍体细胞KMB17中进行连续传代后,收获不同代次的病毒,提取病毒RNA,用二代高通量深度测序方法,测定不同代次病毒(K7,K10,Kll,K13,K15,K18)的全基因序列,对比分析病毒的基因变异率,同时对病毒的感染性滴度进行检测和对比.结果 H2M20K7主代毒种经连续传代后,不同代次病毒的全基因序列总体变异率较低,非同义突变率小于0.58%,基因结构稳定;在5'NCR非编码区域的基因突变率<0.1%;在VP1/2 A、2C毒力位点区域突变率小于0.01%;不同代次病毒的感染性滴度维持在7.76~ 8.50 lgCCID50/ml之间,P值为0.981差异无统计学意义.结论 H2M20K7主代毒种、工作毒种、疫苗批病毒及经过连续传代后的各代次病毒基因结构稳定;在5'NCR非编码区未发生明显突变,毒力相关位点VP1/2 A、2B、2C等关键位点的基因均为减毒特征,变异率极低,未引起病毒毒力特征改变.病毒感染性稳定且符合要求,具有较好的遗传稳定性.

作者:王东宝;曹晗;郑勇;史小军;马忠飞;段颖融;邓燕;孙明波

来源:中华实验和临床病毒学杂志 2018 年 32卷 1期

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王东宝;曹晗;郑勇;史小军;马忠飞;段颖融;邓燕;孙明波
来源:
中华实验和临床病毒学杂志 2018 年 32卷 1期
标签:
甲肝病毒H2株 基因稳定性 二代高通量全基因测序 核苷酸序列 Hepatitis A virus vaccine strain H2 Genetic stability Illumina hiSeq Complete genome sequencing Nucleotide sequence
目的 分析甲型肝炎减毒活疫苗H2株(hepatitis A virus H2 live attenuated vaccine strain)毒种H2M20K7(K7)经连续传代后病毒基因的遗传稳定性.方法 将H2株毒种K7用细胞工厂在人二倍体细胞KMB17中进行连续传代后,收获不同代次的病毒,提取病毒RNA,用二代高通量深度测序方法,测定不同代次病毒(K7,K10,Kll,K13,K15,K18)的全基因序列,对比分析病毒的基因变异率,同时对病毒的感染性滴度进行检测和对比.结果 H2M20K7主代毒种经连续传代后,不同代次病毒的全基因序列总体变异率较低,非同义突变率小于0.58%,基因结构稳定;在5'NCR非编码区域的基因突变率<0.1%;在VP1/2 A、2C毒力位点区域突变率小于0.01%;不同代次病毒的感染性滴度维持在7.76~ 8.50 lgCCID50/ml之间,P值为0.981差异无统计学意义.结论 H2M20K7主代毒种、工作毒种、疫苗批病毒及经过连续传代后的各代次病毒基因结构稳定;在5'NCR非编码区未发生明显突变,毒力相关位点VP1/2 A、2B、2C等关键位点的基因均为减毒特征,变异率极低,未引起病毒毒力特征改变.病毒感染性稳定且符合要求,具有较好的遗传稳定性.