9株甲型肝炎病毒流行株全基因组特征分析-临床诊疗知识库

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作者：

杜凤雪；曹经瑗；周文亭；毕胜利

来源：

中华实验和临床病毒学杂志 2020 年 34卷 2期

标签：

甲型肝炎病毒系统进化分析分子流行病学 Hepatitis A virus Phylogenetic analysis Molecular epidemiology

目的:分析四川南充和新疆和田甲型肝炎病毒(hepatitis A virus, HAV)分离株全基因组序列特征。方法:收集2006年四川南充同1起暴发的3份和2016年新疆和田6份急性期甲肝患者血清标本，通过核酸提取、逆转录、分段巢式PCR、测序和序列拼接获得9条HAV全基因组序列。利用生物信息学软件进行系统进化、抗原中和位点、重组和选择压力分析。结果:VP1-2A连接区基因分型表明9条HAV序列都属于IA亚型，分为4个不同的分支，其中3条南充序列和3条和田序列属于同一分支；全基因组序列表明，3条南充序列核苷酸和氨基酸同源性分别为99.99

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