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目的:开展2016—2018年长沙市人群感染和活禽市场(live poultry markets, LPMs)环境污染H5N6亚型禽流感病毒(avian influenza virus, AIV)监测,为防控人感染H5N6亚型AIV提供实验室数据。方法:采集2016—2018年长沙市流感样病例和不明原因肺炎病例咽拭子6 909份及LPMs环境样品1 719份,利用实时RT-PCR进行A型、H5、H7、H9和N6亚型AIV核酸扩增,并对82份AIV核酸阳性样品进行高通量核苷酸测序,然后对测序结果进行BLAST比对和氨基酸(amino acids, aa)关键位点分析。结果:从6 909份病例的咽拭子样品中检出H5N6亚型AIV核酸阳性1份,从1 719份LPMs环境样品中检出A型AIV核酸阳性927份(53.93

作者:张如胜;陈静芳;黄政;姚栋;叶文;刘晓蕾;李灵之;欧新华;孙边成

来源:中华实验和临床病毒学杂志 2021 年 35卷 1期

知识库介绍

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作者:
张如胜;陈静芳;黄政;姚栋;叶文;刘晓蕾;李灵之;欧新华;孙边成
来源:
中华实验和临床病毒学杂志 2021 年 35卷 1期
标签:
流感样病例 活禽市场 禽流感病毒 H5N6亚型 基因 Influenza-like cases Live poultry market Avian influenza virus H5N6 subtype Gene
目的:开展2016—2018年长沙市人群感染和活禽市场(live poultry markets, LPMs)环境污染H5N6亚型禽流感病毒(avian influenza virus, AIV)监测,为防控人感染H5N6亚型AIV提供实验室数据。方法:采集2016—2018年长沙市流感样病例和不明原因肺炎病例咽拭子6 909份及LPMs环境样品1 719份,利用实时RT-PCR进行A型、H5、H7、H9和N6亚型AIV核酸扩增,并对82份AIV核酸阳性样品进行高通量核苷酸测序,然后对测序结果进行BLAST比对和氨基酸(amino acids, aa)关键位点分析。结果:从6 909份病例的咽拭子样品中检出H5N6亚型AIV核酸阳性1份,从1 719份LPMs环境样品中检出A型AIV核酸阳性927份(53.93