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目的:明确我国大陆地区基因1a亚型丙型肝炎病毒系统进化的情况。方法收集慢性丙型肝炎患者的血清标本,采用逆转录-巢式PCR扩增HCV基因组部分NS5B区和(或)部分核心/E1区片段。根据测序结果构建系统进化树,分析大陆地区基因1a亚型丙型肝炎病毒系统进化情况。结果共收集全国23个中心共1012例患者标本,其中970例标本分型成功,基因1a亚型患者4例。以美国国立卫生院丙型肝炎数据库中不同国家来源丙型肝炎病毒序列为参考构建系统进化树成功。系统进化分析提示,4株HCV 1a亚型部分NS5B区序列散在分布于进化树中的不同分支,来源于不同国家。结论基因1a型HCV由国外传播入我国,在中国丙型肝炎病毒感染者中所占比率低,在大陆地区随机流行。

作者:杨松;鞠威;冯胜虎;全敏;王琦;刘顺爱;邢卉春;成军

来源:中华实验和临床感染病杂志(电子版) 2014 年 4期

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作者:
杨松;鞠威;冯胜虎;全敏;王琦;刘顺爱;邢卉春;成军
来源:
中华实验和临床感染病杂志(电子版) 2014 年 4期
标签:
肝炎病毒,丙型 基因型 系统进化分析 Hepatitis C virus Genotype Phylogenetic analysis
目的:明确我国大陆地区基因1a亚型丙型肝炎病毒系统进化的情况。方法收集慢性丙型肝炎患者的血清标本,采用逆转录-巢式PCR扩增HCV基因组部分NS5B区和(或)部分核心/E1区片段。根据测序结果构建系统进化树,分析大陆地区基因1a亚型丙型肝炎病毒系统进化情况。结果共收集全国23个中心共1012例患者标本,其中970例标本分型成功,基因1a亚型患者4例。以美国国立卫生院丙型肝炎数据库中不同国家来源丙型肝炎病毒序列为参考构建系统进化树成功。系统进化分析提示,4株HCV 1a亚型部分NS5B区序列散在分布于进化树中的不同分支,来源于不同国家。结论基因1a型HCV由国外传播入我国,在中国丙型肝炎病毒感染者中所占比率低,在大陆地区随机流行。