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目的 优化三阴乳腺癌(TNBC)适配子筛选中单链DNA(ssDNA)文库扩增条件,探讨次级ssDNA最佳制备方法.方法 构建ssDNA文库,设置不同的模板量(1012、1011、1010、109、108、107、106、105条带)、循环数(9、12、15、18、21、24、27、30)、DNA聚合酶量(0.025、0.050、0.100、0.200、0.400 U/μl)进行聚合酶链反应(PCR)扩增;对比3种制备次级ssDNA的方法,取其中最佳方法进行筛选.结果 20μl体系最优扩增条件为:ssDNA模板量108个条带、扩增循环数为12、DNA聚合酶量为0.100 U/μl;不对称PCR法所得ssDNA量最多.结论 确立了ssDNA文库最优扩增条件及次级ssDNA最佳制备方法,为进一步筛选TNBC特异性适配子提供实验基础.

作者:王芹芹;胡慧;崔军威;韦伟

来源:中华实验外科杂志 2014 年 31卷 12期

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作者:
王芹芹;胡慧;崔军威;韦伟
来源:
中华实验外科杂志 2014 年 31卷 12期
标签:
单链DNA 适配子 三阴乳腺癌 Single-stranded DNA Aptamer Triple negative breast cancer
目的 优化三阴乳腺癌(TNBC)适配子筛选中单链DNA(ssDNA)文库扩增条件,探讨次级ssDNA最佳制备方法.方法 构建ssDNA文库,设置不同的模板量(1012、1011、1010、109、108、107、106、105条带)、循环数(9、12、15、18、21、24、27、30)、DNA聚合酶量(0.025、0.050、0.100、0.200、0.400 U/μl)进行聚合酶链反应(PCR)扩增;对比3种制备次级ssDNA的方法,取其中最佳方法进行筛选.结果 20μl体系最优扩增条件为:ssDNA模板量108个条带、扩增循环数为12、DNA聚合酶量为0.100 U/μl;不对称PCR法所得ssDNA量最多.结论 确立了ssDNA文库最优扩增条件及次级ssDNA最佳制备方法,为进一步筛选TNBC特异性适配子提供实验基础.