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目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)小核仁RNA宿主基因3(SNHG3)在胃癌组织的表达及其临床意义.方法 利用癌症基因图集(TCGA)数据分析SNHG3在35例癌旁组织、56例Ⅰ期胃癌组织、123例Ⅱ期胃癌组织、169例Ⅲ期胃癌组织和41例Ⅳ期胃癌组织中的表达水平.利用Kaplan-Meier生存分析探讨SNHG3表达水平与胃癌患者的生存时间之间的关系.应用生物信息学手段分析SNHG3共表达基因影响的生物进程和信号通路.结果 lncRNA SNHG3在Ⅰ期胃癌(124.40±10.51,P=0.034)、Ⅱ期胃癌(128.10±9.88,P=0.003)、Ⅲ期胃癌(136.40±7.55,P=0.000)和Ⅳ期胃癌(125.10±13.34,P=0.004)中的表达水平均显著高于癌旁组织(67.16±8.19),并且SNHG3表达量高的胃癌患者的生存时间较短.生物信息学预测显示SNHG3广泛参与RNA剪接、电子呼吸链的传递、mRNA加工、细胞外基质组织、细胞黏附、骨架系统开发、胶原蛋白分解代谢过程、脂肪酸代谢、剪接复合物、癌症通路、磷酸肌醇3激酶(PI3K)-蛋白激酶B(Akt)信号通路、RAP相关蛋白RAP-1A(Rap1)信号通路、Hippo信号通路等在内的多个生物学进程.结论 lncRNASNHG3在胃癌组织中显著高表达,SNHG3表达量高的胃癌患者生存期短.

作者:张子龙;熊斌;庞典付;张克难

来源:中华实验外科杂志 2018 年 35卷 3期

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作者:
张子龙;熊斌;庞典付;张克难
来源:
中华实验外科杂志 2018 年 35卷 3期
标签:
长链非编码RNA 胃癌 生物标志物 Long non-coding RNA Gastric cancer Biomarker
目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)小核仁RNA宿主基因3(SNHG3)在胃癌组织的表达及其临床意义.方法 利用癌症基因图集(TCGA)数据分析SNHG3在35例癌旁组织、56例Ⅰ期胃癌组织、123例Ⅱ期胃癌组织、169例Ⅲ期胃癌组织和41例Ⅳ期胃癌组织中的表达水平.利用Kaplan-Meier生存分析探讨SNHG3表达水平与胃癌患者的生存时间之间的关系.应用生物信息学手段分析SNHG3共表达基因影响的生物进程和信号通路.结果 lncRNA SNHG3在Ⅰ期胃癌(124.40±10.51,P=0.034)、Ⅱ期胃癌(128.10±9.88,P=0.003)、Ⅲ期胃癌(136.40±7.55,P=0.000)和Ⅳ期胃癌(125.10±13.34,P=0.004)中的表达水平均显著高于癌旁组织(67.16±8.19),并且SNHG3表达量高的胃癌患者的生存时间较短.生物信息学预测显示SNHG3广泛参与RNA剪接、电子呼吸链的传递、mRNA加工、细胞外基质组织、细胞黏附、骨架系统开发、胶原蛋白分解代谢过程、脂肪酸代谢、剪接复合物、癌症通路、磷酸肌醇3激酶(PI3K)-蛋白激酶B(Akt)信号通路、RAP相关蛋白RAP-1A(Rap1)信号通路、Hippo信号通路等在内的多个生物学进程.结论 lncRNASNHG3在胃癌组织中显著高表达,SNHG3表达量高的胃癌患者生存期短.