目的:探讨神经母细胞瘤(NB)复发过程中长链非编码RNA(lncRNA) LINC01355的表达及作用机制。方法:在TARGET数据库检索NB数据集,进行差异表达分析筛选差异表达的lncRNA并进行生物信息学分析。荧光实时定量反转录-聚合酶链反应(RT-qPCR)法检测20例原发NB组织及10例复发NB组织中部分差异分子的表达,对数据库结果进行验证,组间比较采用
t检验。
结果:LINC01355在复发NB组织中表达水平(1.935±1.242)明显低于原发肿瘤组织(6.800±5.107,
Z=3.395,
P<0.01)。将患者按LINC01355表达的中位数分为两个亚组,并使用Kaplan-Meier方法估算这两个亚组的总生存时间,结果表明,LINC01355高表达对应患者预后情况较好(
χ2=6.002,
P<0.05)。应用Starbase 3.0数据库分析LINC01355的靶基因及功能,GO富集分析结果显示LINC01355调控的靶基因参与了自噬调节、神经元凋亡过程、类固醇生物合成等过程;京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析显示LINC01355及其靶基因参与了乏氧诱导因子-1α(HIF-1α)通路的调控。对LINC01355及其靶基因法尼基二磷酸法尼基转移酶1(FDFT1) mRNA在原发及复发NB组织中表达进行验证,结果发现复发NB组织中LINC01355表达(0.926±0.223)低于原发肿瘤(2.695±1.
作者:耿建磊;王晓宇;赵力搏;段菲;王朝龙;牛会忠
来源:中华实验外科杂志 2022 年 39卷 4期