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目的:采用生物信息学方法分析中心体蛋白55(CEP55)在肺腺癌中的表达,探究CEP55在肺腺癌中的潜在机制及其临床意义。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载肺腺癌转录组和临床数据,借助R语言和Perl软件进行数据处理,使用Wilcoxon秩和检验、Kruskal-Wallis检验及logistics回归分析CEP55表达差异性以及与临床病理参数的相关性,Kaplan-Meier和Cox回归分析肺腺癌患者预后影响因素;使用基因富集分析(GSEA)方法分析预测CEP55在肺腺癌中参与的信号通路。组间比较采用Wilcoxon秩和检验,多组比较采用Kruskal-Wallis检验。结果:CEP55在肺腺癌组织中的表达量明显高于癌旁组织[6.151(2.671,10.464)比0.628(0.428,0.932), Z=-11.959, P<0.05],CEP55表达量与年龄[<65岁7.220(3.590,11.062)比≥65岁5.320(2.194,9.386), Z=-3.478, P<0.05]、性别[女性5.315(2.218,9.379)比男性7.213(2.903,11.533), Z=-3.049, P<0.05]、肿瘤分期[Ⅰ 4.969(2.163,8.927)比Ⅱ 6.913(3.397,11.513)比Ⅲ 7.444(4.127,13.286)比Ⅳ 8.192(2.624,13.623), χ2=21.624, P<0.05]、T分期[T 1 4.166(1.964,7.978)比T 2 6.949(3.458,11.354)比T

作者:涂顺珂;冯旭;蔡长伟;黄勋功

来源:中华实验外科杂志 2022 年 39卷 8期

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作者:
涂顺珂;冯旭;蔡长伟;黄勋功
来源:
中华实验外科杂志 2022 年 39卷 8期
标签:
中心体蛋白55 肺腺癌 基因表达 信号通路 Centrosomal protein 55 Lung adenocarcinoma Gene expression Signal pathway
目的:采用生物信息学方法分析中心体蛋白55(CEP55)在肺腺癌中的表达,探究CEP55在肺腺癌中的潜在机制及其临床意义。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载肺腺癌转录组和临床数据,借助R语言和Perl软件进行数据处理,使用Wilcoxon秩和检验、Kruskal-Wallis检验及logistics回归分析CEP55表达差异性以及与临床病理参数的相关性,Kaplan-Meier和Cox回归分析肺腺癌患者预后影响因素;使用基因富集分析(GSEA)方法分析预测CEP55在肺腺癌中参与的信号通路。组间比较采用Wilcoxon秩和检验,多组比较采用Kruskal-Wallis检验。结果:CEP55在肺腺癌组织中的表达量明显高于癌旁组织[6.151(2.671,10.464)比0.628(0.428,0.932), Z=-11.959, P<0.05],CEP55表达量与年龄[<65岁7.220(3.590,11.062)比≥65岁5.320(2.194,9.386), Z=-3.478, P<0.05]、性别[女性5.315(2.218,9.379)比男性7.213(2.903,11.533), Z=-3.049, P<0.05]、肿瘤分期[Ⅰ 4.969(2.163,8.927)比Ⅱ 6.913(3.397,11.513)比Ⅲ 7.444(4.127,13.286)比Ⅳ 8.192(2.624,13.623), χ2=21.624, P<0.05]、T分期[T 1 4.166(1.964,7.978)比T 2 6.949(3.458,11.354)比T