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目的:探究缺血预处理(IP)对肾脏缺血再灌注损伤(IRI)的保护作用。方法:将18只购自湖南斯莱克公司的雄性C57BL/6J小鼠完全随机分为假手术组(Sham),缺血再灌注组(I/R)和缺血预处理组(IP)3组,使用肌酐(SCr)、尿素氮(BUN)和Paller评分来判断肾脏损伤程度,对IRI组和IP组进行转录组测序,对测序结果进行KEGG聚类分析和蛋白相互作用分析,并对结果进行定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)和蛋白质印迹法(Western blot)验证,采用 t检验进行两组间的比较。 结果:IP组损伤低于I/R组,IP组的SCr低于I/R组(141.6±15.38比193.10±10.55, t=6.185, P<0.01)、IP组BUN低于I/R组(39.44±2.44比54.96±6.54, t=4.957, P<0.01),以及Paller评分IP组低于I/R组(27.12±2.28比43.53±3.34, t=9.084, P<0.01)。测序结果示IP组比I/R组有1 560个差异基因,其中863个表达升高,697个降低。KEGG富集通路分析差异最大的为甘氨酸,丝氨酸和苏氨酸代谢通路,通过RT-qPCR和Western blot对测序结果进行验证,Western blot结果表明IP组氨基酸氨基转移酶(GATM)表达高于I/R组(0.421±0.280比0.186±0.023, t=9.188, P<0.01)。 结论:IP可能通过影响甘氨酸、丝

作者:陈奕文;罗军;胡前超;熊艳;钟自彪;叶啟发

来源:中华实验外科杂志 2022 年 39卷 10期

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作者:
陈奕文;罗军;胡前超;熊艳;钟自彪;叶啟发
来源:
中华实验外科杂志 2022 年 39卷 10期
标签:
缺血再灌注损伤 缺血预处理 转录组测序 生信分析 Ischemia reperfusion injury Ischemia Preconditioning RNA-seq Bioinformatics analysis
目的:探究缺血预处理(IP)对肾脏缺血再灌注损伤(IRI)的保护作用。方法:将18只购自湖南斯莱克公司的雄性C57BL/6J小鼠完全随机分为假手术组(Sham),缺血再灌注组(I/R)和缺血预处理组(IP)3组,使用肌酐(SCr)、尿素氮(BUN)和Paller评分来判断肾脏损伤程度,对IRI组和IP组进行转录组测序,对测序结果进行KEGG聚类分析和蛋白相互作用分析,并对结果进行定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)和蛋白质印迹法(Western blot)验证,采用 t检验进行两组间的比较。 结果:IP组损伤低于I/R组,IP组的SCr低于I/R组(141.6±15.38比193.10±10.55, t=6.185, P<0.01)、IP组BUN低于I/R组(39.44±2.44比54.96±6.54, t=4.957, P<0.01),以及Paller评分IP组低于I/R组(27.12±2.28比43.53±3.34, t=9.084, P<0.01)。测序结果示IP组比I/R组有1 560个差异基因,其中863个表达升高,697个降低。KEGG富集通路分析差异最大的为甘氨酸,丝氨酸和苏氨酸代谢通路,通过RT-qPCR和Western blot对测序结果进行验证,Western blot结果表明IP组氨基酸氨基转移酶(GATM)表达高于I/R组(0.421±0.280比0.186±0.023, t=9.188, P<0.01)。 结论:IP可能通过影响甘氨酸、丝