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目的 探究特异性蛋白1(SP1)在肝癌组织中的表达及其与相关临床特征的关联,分析其在肝癌中的诊断和预后价值.方法 选取华中科技大学同济医学院附属武汉中心医院2017年1月至2019年1月期间30例住院接受手术切除的肝细胞肝癌患者的癌和对应癌旁组织标本,其中男28例、女2例,年龄(48.0±7.3)岁.采用免疫组织化学方法(IHC)检测SP1的表达.从高通量基因表达数据库(GEO)和癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载肝癌患者的基因表达数据以及临床信息,以分析SP1在癌和癌旁组织中的差异表达.利用受试者工作特征曲线(ROC)评估SP1区分肝癌和正常组织的能力.根据SP1表达中位数,将患者分为高表达组(181例)和低表达组(181例),并进行Kaplan-Meier生存分析.利用基因集富集分析(GSEA)研究SP1调控的潜在分子机制.结果 IHC显示SP1在肝癌组织中的阳性表达率明显高于癌旁组织[80%(24/30)比40%(12/30),x2=8.403,P<0.01].对TCGA和GEO数据集分析显示SP1的表达水平与肝癌分化程度相关(r=0.197,P<0.01);ROC分析表明,SP1诊断肝癌的ROC曲线下面积均大于0.7;Kaplan-Meier 分析显示高表达 SP1肝癌患者的总体生存期(OS)低于低表达SP1的肝癌患者(中位OS:3.83年比4.91年,x2=4.592,P<0.05);单因素COX回归分析显示SP1是影响肝癌预后的危险因素(风

作者:颜俊伟;周磊;姜挺;刘璟;甘洪颖;张姮

来源:中华实验外科杂志 2023 年 40卷 11期

知识库介绍

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作者:
颜俊伟;周磊;姜挺;刘璟;甘洪颖;张姮
来源:
中华实验外科杂志 2023 年 40卷 11期
标签:
肝癌 特异性蛋白1 诊断 预后 基因集富集分析 Hepatocellular carcinoma Specificity protein 1 Diagnosis Prognosis Gene set enrichment analysis
目的 探究特异性蛋白1(SP1)在肝癌组织中的表达及其与相关临床特征的关联,分析其在肝癌中的诊断和预后价值.方法 选取华中科技大学同济医学院附属武汉中心医院2017年1月至2019年1月期间30例住院接受手术切除的肝细胞肝癌患者的癌和对应癌旁组织标本,其中男28例、女2例,年龄(48.0±7.3)岁.采用免疫组织化学方法(IHC)检测SP1的表达.从高通量基因表达数据库(GEO)和癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载肝癌患者的基因表达数据以及临床信息,以分析SP1在癌和癌旁组织中的差异表达.利用受试者工作特征曲线(ROC)评估SP1区分肝癌和正常组织的能力.根据SP1表达中位数,将患者分为高表达组(181例)和低表达组(181例),并进行Kaplan-Meier生存分析.利用基因集富集分析(GSEA)研究SP1调控的潜在分子机制.结果 IHC显示SP1在肝癌组织中的阳性表达率明显高于癌旁组织[80%(24/30)比40%(12/30),x2=8.403,P<0.01].对TCGA和GEO数据集分析显示SP1的表达水平与肝癌分化程度相关(r=0.197,P<0.01);ROC分析表明,SP1诊断肝癌的ROC曲线下面积均大于0.7;Kaplan-Meier 分析显示高表达 SP1肝癌患者的总体生存期(OS)低于低表达SP1的肝癌患者(中位OS:3.83年比4.91年,x2=4.592,P<0.05);单因素COX回归分析显示SP1是影响肝癌预后的危险因素(风