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目的 评价IS6110限制性片段长度多态性(IS6110-RFLP)、间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)及多位点可变数量串联重复序列分析(MLVA)3种方法在结核分枝杆菌基因分型研究中的应用.方法 分别采用IS6110-RFLP、Spoligotyping及MLVA对40株结核分枝杆菌临床分离株进行基因分型研究,比较3种方法的分型效果.结果 使用IS6110-RFLP方法,40株结核分枝杆菌呈现出35种基因型,33株具有独特的基因型;使用Spoligotyping方法,40株结核分枝杆菌呈现出17种基因型,11株具有独特的基因型;使用MLVA方法时,40株结核分枝杆菌呈现出34种基因型,29株具有独特的基因型;当3种方法联合使用时,40株结核分枝杆菌呈现出39种基因型,38株具有独特的基因型.结论 MLVA和IS6110-RFLP方法的分辨率高于Spoligotyping,但是对于IS6110单拷贝或低拷贝的菌株,MLVA方法的分辨率要高于IS6110-RFLP.MLVA、IS6110-RFLP和Spoligotyping联合应用可有效地进行结核病的流行病学调查和病原学监测.

作者:董海燕;谭云洪;刘志广;赵秀芹;阳波;万康林

来源:中华微生物学和免疫学杂志 2007 年 27卷 5期

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作者:
董海燕;谭云洪;刘志广;赵秀芹;阳波;万康林
来源:
中华微生物学和免疫学杂志 2007 年 27卷 5期
标签:
限制性片段长度多态性 间隔区寡核苷酸分型 可变数量串联重复序列 基因分型 结核分枝杆菌
目的 评价IS6110限制性片段长度多态性(IS6110-RFLP)、间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)及多位点可变数量串联重复序列分析(MLVA)3种方法在结核分枝杆菌基因分型研究中的应用.方法 分别采用IS6110-RFLP、Spoligotyping及MLVA对40株结核分枝杆菌临床分离株进行基因分型研究,比较3种方法的分型效果.结果 使用IS6110-RFLP方法,40株结核分枝杆菌呈现出35种基因型,33株具有独特的基因型;使用Spoligotyping方法,40株结核分枝杆菌呈现出17种基因型,11株具有独特的基因型;使用MLVA方法时,40株结核分枝杆菌呈现出34种基因型,29株具有独特的基因型;当3种方法联合使用时,40株结核分枝杆菌呈现出39种基因型,38株具有独特的基因型.结论 MLVA和IS6110-RFLP方法的分辨率高于Spoligotyping,但是对于IS6110单拷贝或低拷贝的菌株,MLVA方法的分辨率要高于IS6110-RFLP.MLVA、IS6110-RFLP和Spoligotyping联合应用可有效地进行结核病的流行病学调查和病原学监测.