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目的:了解2006-2011年间青岛地区流行的B型流感病毒的全基因组进化特征。方法选取2006-2011年间青岛地区分离的B型流感病毒,提取病毒RNA,应用逆转录聚合酶链反应( RT-PCR)扩增各基因片段,并进行序列测定;Sequencher 软件完成序列拼接。 MEGA5.0软件对各基因片段进行系统发育分析及分子特征分析。结果在血凝素( HA)基因进化树上,Victoria系V1分支为B/Malaysia/2506/2004样毒株,包含2006-2009年13个毒株,V2分支为B/Brisbane/60/2008样毒株,包含2009-2011年12个毒株;Yamagata 系全部为 B/Florida/4/2006样毒株, Y1分支包含2006-2008年5个毒株,Y2分支包含2010-2011年7个毒株。全基因组分析表明V2分支3个毒株发生了5+3重配,1个毒株发生了1+7重配,重配株均与前一季及当季疫苗株同亚型;HA进化树上处于Yamagata系的毒株全部属于基因型2,处于Victoria系的毒株全部属于基因型15;HA1蛋白与疫苗株进行比较:Victoria系分离株主要变异位点包括H14Q、L58P、N129S、I146V、N171D、R279K;Yamaga-ta系分离株主要变异位点包括R48K、K88R、P108A、N116K、S150I、N165Y、D196N、N202S、S229G;位点116和129、位点150、位点165、位点196和202分处以往证实经历阳性选择的抗原表位120环、150环、160环和

作者:杨婷婷;柴青;段海平;于萍;刘晓琳;汪照国

来源:中华微生物学和免疫学杂志 2014 年 4期

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作者:
杨婷婷;柴青;段海平;于萍;刘晓琳;汪照国
来源:
中华微生物学和免疫学杂志 2014 年 4期
标签:
流感病毒B型 全基因组 抗原变异 进化 Influenza B virus Whole-genome Antigenic variation Evolution
目的:了解2006-2011年间青岛地区流行的B型流感病毒的全基因组进化特征。方法选取2006-2011年间青岛地区分离的B型流感病毒,提取病毒RNA,应用逆转录聚合酶链反应( RT-PCR)扩增各基因片段,并进行序列测定;Sequencher 软件完成序列拼接。 MEGA5.0软件对各基因片段进行系统发育分析及分子特征分析。结果在血凝素( HA)基因进化树上,Victoria系V1分支为B/Malaysia/2506/2004样毒株,包含2006-2009年13个毒株,V2分支为B/Brisbane/60/2008样毒株,包含2009-2011年12个毒株;Yamagata 系全部为 B/Florida/4/2006样毒株, Y1分支包含2006-2008年5个毒株,Y2分支包含2010-2011年7个毒株。全基因组分析表明V2分支3个毒株发生了5+3重配,1个毒株发生了1+7重配,重配株均与前一季及当季疫苗株同亚型;HA进化树上处于Yamagata系的毒株全部属于基因型2,处于Victoria系的毒株全部属于基因型15;HA1蛋白与疫苗株进行比较:Victoria系分离株主要变异位点包括H14Q、L58P、N129S、I146V、N171D、R279K;Yamaga-ta系分离株主要变异位点包括R48K、K88R、P108A、N116K、S150I、N165Y、D196N、N202S、S229G;位点116和129、位点150、位点165、位点196和202分处以往证实经历阳性选择的抗原表位120环、150环、160环和