目的:对2016—2017年中国湖北襄阳地区分离的埃可病毒11型(Echovirus 11，Echo11)基于VP1基因进行分子进化特征分析。方法:采集2016—2017年中国湖北襄阳地区手足口病患儿肛拭子或咽拭子标本，应用real-time RT-PCR技术对肠道病毒阳性样本进行筛选，对肛拭子或咽拭子样本进行病毒分离。采用常规RT-PCR方法对在人横纹肌瘤细胞上分离的Echo11病毒襄阳流行株VP1区和3株代表株全长基因扩增并进行序列分析，使用DNAStar7.0软件包中的MegAlign、MEGA6.0中的Data和Phylogeny软件对核苷酸和氨基酸序列同源性、突变位点进行分析和构建系统进化树等。使用SimPlot软件进行重组分析，对3株代表株全长序列和GenBank中下载的核苷酸序列进行BootScan扫描，生成相似性图。结果:本研究从3 494份手足口病患儿样本中共分离出Echo11病毒11株，占比0.31
作者：魏真妮；钱莎莎；童叶青；徐长征；卢佳；郭靖；王文辉；周艳萍；王泽鋆；孟胜利；陈晓琦；官旭华；申硕
来源：中华微生物学和免疫学杂志 2021 年 41卷 2期
