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目的:对2014—2018年云南省文山州手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)病例进行病原分析,并对其中分离的柯萨奇病毒A6型(coxsackievirus A6, CV-A6)进行分子流行病学分析。方法:用RD细胞和Hep-2细胞从HFMD病例粪便标本中分离病毒,提取病毒RNA,先用MD91/OL68-1引物对病毒VP4/VP2结合区基因进行RT-PCR和测序,确定病毒型别,再用各型病毒的相关引物扩增肠道病毒(enterovirus,EV)VP1区全序并测序;按参考文献下载基因库中CV-A6病毒完整VP1区基因参考序列,用MEGA5.2软件构建系统进化树,进行基因特征和分子流行病学分析。结果:5年间共从2 848份标本中分离到581株EV,病毒分离率为20.40

作者:周雪花;周永明;姜黎黎;李楠;周晓芳;寸建萍;伏晓庆;田炳均

来源:中华微生物学和免疫学杂志 2021 年 41卷 8期

知识库介绍

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作者:
周雪花;周永明;姜黎黎;李楠;周晓芳;寸建萍;伏晓庆;田炳均
来源:
中华微生物学和免疫学杂志 2021 年 41卷 8期
标签:
手足口病 病原分析 柯萨奇病毒A6型 VP1基因 分子流行病学 Hand, foot and mouth disease Etiology analysis Coxsackievirus A6 VP1 gene Molecular epidemiology
目的:对2014—2018年云南省文山州手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)病例进行病原分析,并对其中分离的柯萨奇病毒A6型(coxsackievirus A6, CV-A6)进行分子流行病学分析。方法:用RD细胞和Hep-2细胞从HFMD病例粪便标本中分离病毒,提取病毒RNA,先用MD91/OL68-1引物对病毒VP4/VP2结合区基因进行RT-PCR和测序,确定病毒型别,再用各型病毒的相关引物扩增肠道病毒(enterovirus,EV)VP1区全序并测序;按参考文献下载基因库中CV-A6病毒完整VP1区基因参考序列,用MEGA5.2软件构建系统进化树,进行基因特征和分子流行病学分析。结果:5年间共从2 848份标本中分离到581株EV,病毒分离率为20.40