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目的 建立骨髓增生异常综合征(MDS)的CpG岛甲基化模式,为MDS的早期诊断和鉴别诊断提供新的生物学标志.方法 采用Illumina450k甲基化芯片和Agilent全基因组表达谱基因芯片进行差异基因筛选,筛选出高甲基化低表达基因,初步建立MDS的CpG岛甲基化模式.通过甲基化特异性PCR、重硫酸盐测序和实时荧光定量PCR进一步在MDS患者组及对照组(非恶性血液病患者)中进行验证,最终建立CpG岛甲基化模式.最后采用诊断试验评价的方法评价CpG岛甲基化模式诊断MDS的效能.结果 通过甲基化芯片和表达谱基因芯片的关联分析,以及在211例MDS患者组和60例对照组中进行验证,建立的MDS CpG岛甲基化模式为高甲基化低表达的6个基因.6个基因在MDS组发生甲基化的比例分别为ABAT (97%)、DAPP1 (98%)、FADD(89%)、LRRFIP1 (96%)、PLBD1 (89%)和SMPD3 (85%).5个或5个以上基因同时发生甲基化时诊断MDS的特异度和灵敏度为95.0%和91.4%,准确度为92.3%.结论 由ABAT、DAPP1、FADD、LRRFIP1、PLBD1、SMPD3这6个基因建立的MDS的CpG岛甲基化模式可以提高MDS诊断的准确性及鉴别诊断效能.

作者:赵晓丽;王小钦;李爽;李念夷;马燕;林果为

来源:中华血液学杂志 2014 年 35卷 10期

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作者:
赵晓丽;王小钦;李爽;李念夷;马燕;林果为
来源:
中华血液学杂志 2014 年 35卷 10期
标签:
骨髓增生异常综合征 CpG岛 甲基化 诊断 Myelodysplastic syndromes CpG islands Methylation Diagnosis
目的 建立骨髓增生异常综合征(MDS)的CpG岛甲基化模式,为MDS的早期诊断和鉴别诊断提供新的生物学标志.方法 采用Illumina450k甲基化芯片和Agilent全基因组表达谱基因芯片进行差异基因筛选,筛选出高甲基化低表达基因,初步建立MDS的CpG岛甲基化模式.通过甲基化特异性PCR、重硫酸盐测序和实时荧光定量PCR进一步在MDS患者组及对照组(非恶性血液病患者)中进行验证,最终建立CpG岛甲基化模式.最后采用诊断试验评价的方法评价CpG岛甲基化模式诊断MDS的效能.结果 通过甲基化芯片和表达谱基因芯片的关联分析,以及在211例MDS患者组和60例对照组中进行验证,建立的MDS CpG岛甲基化模式为高甲基化低表达的6个基因.6个基因在MDS组发生甲基化的比例分别为ABAT (97%)、DAPP1 (98%)、FADD(89%)、LRRFIP1 (96%)、PLBD1 (89%)和SMPD3 (85%).5个或5个以上基因同时发生甲基化时诊断MDS的特异度和灵敏度为95.0%和91.4%,准确度为92.3%.结论 由ABAT、DAPP1、FADD、LRRFIP1、PLBD1、SMPD3这6个基因建立的MDS的CpG岛甲基化模式可以提高MDS诊断的准确性及鉴别诊断效能.