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目的 分析一起食源性疾病事件中病原的基因组学特征.方法 选取事件中死亡病例血样和洗胃前胃内容物,以及其就餐食物作为样品,共11份,对金黄色葡萄球菌和蜡样芽胞杆菌以及有毒物质进行检测,并对食物中检测到的细菌进行计数.采用实时荧光PCR方法检测分离得到的10株蜡样芽胞杆菌的16 S rDNA保守区基因和呕吐毒素ces基因,并采用二代测序技术对分离株进行了基因组测序,初步分析质粒携带情况,并与公共数据库中参考序列进行比较基因组学分析.结果 所有样品中,仅蜡样芽胞杆菌检测阳性,其中蛋炒饭中蜡样芽胞杆菌计数为1.9×107 CFU/g,干炸鱼和卤猪头肉中均为3.0×103 CFU/g.10株分离株均携带hlyⅢ、nheA、nheB、inlA、inhA毒力基因;携带plcR和nheC基因的菌株均为9株.分离株16 S rDNA保守区基因和ces基因均为阳性,而且均携带完整的ces基因簇序列,并且与分离自英国的AH187株携带的呕吐毒素质粒pCER270(NC_010924.1)和分离自日本的NC7401株携带的质粒pNCcld(NC_016792.1)的序列完全一致.质粒比对结果显示,分离株序列与炭疽杆菌的pXO1和pXO2质粒差异较大,但携带含ces基因的pNCCld质粒.10株分离株基因组系统发生树显示,10株蜡样芽胞杆菌高度相似(系统发生树上距离为2.0×10-6~9.0×10-6)且与AH187株和NC7401株均高度相

作者:汪皓秋;俞骅;郑伟;张蔚;刘涛;楼秀芹;黄春萍;黄利明;沈利明;潘劲草

来源:中华预防医学杂志 2018 年 52卷 6期

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作者:
汪皓秋;俞骅;郑伟;张蔚;刘涛;楼秀芹;黄春萍;黄利明;沈利明;潘劲草
来源:
中华预防医学杂志 2018 年 52卷 6期
标签:
病原 基因组学 序列分析 蜡样芽胞杆菌 二代测序 Noxae Genomics Sequence analysis Bacillus cereus Next generation sequencing
目的 分析一起食源性疾病事件中病原的基因组学特征.方法 选取事件中死亡病例血样和洗胃前胃内容物,以及其就餐食物作为样品,共11份,对金黄色葡萄球菌和蜡样芽胞杆菌以及有毒物质进行检测,并对食物中检测到的细菌进行计数.采用实时荧光PCR方法检测分离得到的10株蜡样芽胞杆菌的16 S rDNA保守区基因和呕吐毒素ces基因,并采用二代测序技术对分离株进行了基因组测序,初步分析质粒携带情况,并与公共数据库中参考序列进行比较基因组学分析.结果 所有样品中,仅蜡样芽胞杆菌检测阳性,其中蛋炒饭中蜡样芽胞杆菌计数为1.9×107 CFU/g,干炸鱼和卤猪头肉中均为3.0×103 CFU/g.10株分离株均携带hlyⅢ、nheA、nheB、inlA、inhA毒力基因;携带plcR和nheC基因的菌株均为9株.分离株16 S rDNA保守区基因和ces基因均为阳性,而且均携带完整的ces基因簇序列,并且与分离自英国的AH187株携带的呕吐毒素质粒pCER270(NC_010924.1)和分离自日本的NC7401株携带的质粒pNCcld(NC_016792.1)的序列完全一致.质粒比对结果显示,分离株序列与炭疽杆菌的pXO1和pXO2质粒差异较大,但携带含ces基因的pNCCld质粒.10株分离株基因组系统发生树显示,10株蜡样芽胞杆菌高度相似(系统发生树上距离为2.0×10-6~9.0×10-6)且与AH187株和NC7401株均高度相