目的 分析和验证重症继发性肺结核患者基因表达谱.方法 收集解放军三○九医院结核病研究所2012年5月至2013年10月住院患者中符合入选标准的继发性肺结核患者103例,根据病情严重程度分为重症组(57例)和轻症组(46例),并以同期进行健康体检且年龄相匹配的45名健康人为对照组.选取重症组4例、轻症组3例和对照组5名用Affymetrix基因表达谱芯片进行全基因组检测和分析,对重症组比对轻症组筛选的差异基因做聚类分析和生物信息学分析;对以上各组剩余的53例、43例和40名用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-PCR)验证芯片结果,其中验证代表基因原癌基因(JUN)表达水平是重症组、轻症组各20例,对照组8名;用方差分析和非参数检验统计方法判断组间的统计学差异.结果 芯片结果显示重症组比对轻症组差异基因为406条,下调基因264条,上调基因142条,差异基因以表达下调为主;聚类分析显示同组样本表达谱有相似性,提示芯片试验有一定重复性,结果可靠;基因本体论注释显示差异基因主要参与了生物学过程,包括免疫反应、信号转导、DNA依赖的转录调节、炎症反应、抗原处理与提呈、趋化作用等;信号通路分析显示差异基因参与了22条炎症和免疫反应相关通路,主要有B细胞受体信号通路、抗原处理与提呈、Toll样受体信号通路、丝裂原活化蛋白激
作者：苏瑾文；刘艳华；杨秉芬；程小星
来源：中华医学杂志 2014 年 94卷 42期
