目的 利用生物信息学方法进一步认识肝癌细胞应对肿瘤坏死因子α(TNF-α)刺激过程中的细胞黏附相关的信号转导网络.方法 利用肝癌细胞HepG2应对TNF-α刺激的基因芯片数据、转录因子数据库HTRI以及蛋白-蛋白相互作用数据库HRPD构建了肝癌细胞应对TNF-α刺激过程中的信号转导网络,并利用网络结构和基因功能聚类的分析方法进行了研究.结果 发现在信号转导网络中MYC、SP1等基因是信号转导网络中的关键转录因子,信号转导网络中的基因与细胞黏附密切相关,EGFR很可能是肝癌细胞应对TNF-α刺激过程中调控细胞黏附的关键基因.结论 EGFR很可能在TNF-α引起的肝癌细胞迁移过程中发挥了关键作用.
作者:郑永昌;杜顺达;徐海峰;徐意瑶;赵海涛;迟天毅;卢欣;桑新亭;毛一雷
来源:中华医学杂志 2014 年 94卷 42期