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目的 应用DiversiLab系统对鲍曼不动杆菌进行基因分型,并评价其可行性.方法 对2005年全国15个城市医院临床分离的58株鲍曼不动杆菌,应用以rep-PCR为原理的DiversiLab系统分型技术进行分型,并与脉冲场凝胶电泳分型和多位点序列分型技术结果进行比较;计算Simpson相关系数(Simpson's index of diversity)比较3种方法的分辨力.结果 DiversiLab系统将58株鲍曼不动杆菌分为5簇流行克隆和25个散发克隆;多位点序列分型技术将其分为35个序列型,并归为一个克隆复合体CC22(Clone Complex 22)和35个单一体(singleton);PFGE将其分成5个流行脉冲型和34个散发克隆.DiversiLab系统、MLST和PFGE的Simpson相关系数分别为0.876、0.944和0.961.结论 DiversiLab系统的操作简单、快速,可重复性好,可以作为大量菌株首选分型方法,但分辨力低于PFGE和MLST两种分型技术.

作者:曲燕燕;王文飞;周华;符一骐;俞云松

来源:中华检验医学杂志 2010 年 33卷 5期

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作者:
曲燕燕;王文飞;周华;符一骐;俞云松
来源:
中华检验医学杂志 2010 年 33卷 5期
标签:
鲍氏不动杆菌 聚合酶链反应 重复序列,核酸 电泳,凝胶,脉冲场 细菌分型技术 可重复性,结果 Acinetobacter baumannii Polymerase chain reaction Repetitive sequences,nucleic acid Electrophoresis,gel pulsed-field Bacterial typing techniques Reproducibility of results
目的 应用DiversiLab系统对鲍曼不动杆菌进行基因分型,并评价其可行性.方法 对2005年全国15个城市医院临床分离的58株鲍曼不动杆菌,应用以rep-PCR为原理的DiversiLab系统分型技术进行分型,并与脉冲场凝胶电泳分型和多位点序列分型技术结果进行比较;计算Simpson相关系数(Simpson's index of diversity)比较3种方法的分辨力.结果 DiversiLab系统将58株鲍曼不动杆菌分为5簇流行克隆和25个散发克隆;多位点序列分型技术将其分为35个序列型,并归为一个克隆复合体CC22(Clone Complex 22)和35个单一体(singleton);PFGE将其分成5个流行脉冲型和34个散发克隆.DiversiLab系统、MLST和PFGE的Simpson相关系数分别为0.876、0.944和0.961.结论 DiversiLab系统的操作简单、快速,可重复性好,可以作为大量菌株首选分型方法,但分辨力低于PFGE和MLST两种分型技术.