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目的:探讨长链非编码RNA ( lncRNA )在潜伏性结核菌感染中差异性表达。方法选择2015年1至6月在珠海市慢性病防治中心诊断的潜伏性结核菌感染患者血浆33例(病例组),纳入标准为年龄范围18~40岁,确诊的涂阳肺结核病例密切接触者;胸部影像学检查正常;皮肤结核菌素试验强阳性;6个月后随访未患活动性肺结核。对照组选自同一机构体检科健康人群血浆33名,纳入标准为年龄范围18~40岁,排除肺结核或其他肺部疾病,皮肤结核菌素试验阴性。病例组和对照组各3例用于lncRNA芯片实验,30例用于RT-PCR验证实验。 Trizol法抽提总RNA后,利用lncRNA芯片技术进行高通量检测,建立潜伏性结核菌感染者的lncRNA基因表达谱。筛选6个差异表达明显的lncRNA,利用实时定量PCR技术,在30例扩大化样本中进行验证,获得高灵敏度、高特异性的生物标志物。利用基因功能分析、基因通路分析初步分析差异基因的表达功能。数据的正态性检验采用Kolmogorov-Smirov(K-S),正态分布资料两个样本均数比较采用t检验,多个样本均数比较采用单因素方差分析,两样本率的比较用χ2检验。结果潜伏性结核感染的特异性差异表达lncRNA共1485个,占所检测lncRNA 总数的4.9%,其中上调819个,下调666个。 ENST00000566054( t=10.92,

作者:欧青叶;顾大勇;周俭中;董秋兰;梁丽娟;林伟基

来源:中华检验医学杂志 2016 年 39卷 11期

知识库介绍

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作者:
欧青叶;顾大勇;周俭中;董秋兰;梁丽娟;林伟基
来源:
中华检验医学杂志 2016 年 39卷 11期
标签:
潜伏性结核 RNA,长链非编码 Latent tuberculosis RNA,long noncoding
目的:探讨长链非编码RNA ( lncRNA )在潜伏性结核菌感染中差异性表达。方法选择2015年1至6月在珠海市慢性病防治中心诊断的潜伏性结核菌感染患者血浆33例(病例组),纳入标准为年龄范围18~40岁,确诊的涂阳肺结核病例密切接触者;胸部影像学检查正常;皮肤结核菌素试验强阳性;6个月后随访未患活动性肺结核。对照组选自同一机构体检科健康人群血浆33名,纳入标准为年龄范围18~40岁,排除肺结核或其他肺部疾病,皮肤结核菌素试验阴性。病例组和对照组各3例用于lncRNA芯片实验,30例用于RT-PCR验证实验。 Trizol法抽提总RNA后,利用lncRNA芯片技术进行高通量检测,建立潜伏性结核菌感染者的lncRNA基因表达谱。筛选6个差异表达明显的lncRNA,利用实时定量PCR技术,在30例扩大化样本中进行验证,获得高灵敏度、高特异性的生物标志物。利用基因功能分析、基因通路分析初步分析差异基因的表达功能。数据的正态性检验采用Kolmogorov-Smirov(K-S),正态分布资料两个样本均数比较采用t检验,多个样本均数比较采用单因素方差分析,两样本率的比较用χ2检验。结果潜伏性结核感染的特异性差异表达lncRNA共1485个,占所检测lncRNA 总数的4.9%,其中上调819个,下调666个。 ENST00000566054( t=10.92,