目的:开展耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌（CRKP）全基因组测序，揭示CRKP院内耐药基因流行状态，指导医院感染防控的开展。方法:收集蚌埠市第三人民医院2018年11月至2019年3月临床分离的CRKP，用VITEK-2 Compact分析仪进行菌种鉴定和药敏实验，筛选出的CRKP用Illumina Hiseq 2500平台全基因组测序，SPAdes-2.0序列拼接，采用cgMLST分型法，分析提取核心基因与耐药基因型、SCOTTI软件构建菌株关联图与传播图。结果:19株CRKP菌株中CT3176基因型13株、CT1313型与CT1689型各2株，其他型2株，CT3176型主要分布在重症医学科，呈流行状态；菌株主要携带β-内酰胺酶（耐碳青霉烯类）中的blaKPC-2（19/19）、blaCTX-M-65（19/19）、blaSHV-11（16/19）、blaTEM-1B（14/19），耐氨基糖苷类中的aadA2（14/19）、rmtB（14/19）、AAC（3）-Ⅱd（12/19）、armA（11/19），耐链霉素中的mph（E）（11/19）、msr（E）（11/19）、mph（A）（10/19），耐磷霉素中的fosA6（19/19）等耐药基因；软件分析出编号7与29菌株之间有42
作者：张倩茹；李甲；孙向东；姚晓玲
来源：中华检验医学杂志 2020 年 43卷 9期
