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目的:评估傅里叶红外光谱技术(FTIR)对临床分离的碳青霉烯耐药大肠埃希菌(CREC)同源性分析的能力。方法:26株CREC为2018年从来自全国9个省、市(湖南、吉林、浙江、福建、上海、安徽、重庆、云南、河南)的样本中分离,FTIR检测菌株在900~1 200 cm -1区域的红外吸收光谱,使用欧式距离和平均连接聚类方法进行多变量分析;并对菌株进行全基因组测序(WGS)分析单核苷酸多态性(SNP)。 结果:FTIR将26株CREC分为14个红外光谱(IR)型,且相同IR型的菌株均属于同一序列(ST)型。相比WGS对CREC的聚类分析,FTIR的聚类分析结果一致性为92.3

作者:卢佳玥;孙巧玲;董宁;刘聪聪;曾裕;胡燕燕;顾丹霞;张嵘

来源:中华检验医学杂志 2021 年 44卷 6期

知识库介绍

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作者:
卢佳玥;孙巧玲;董宁;刘聪聪;曾裕;胡燕燕;顾丹霞;张嵘
来源:
中华检验医学杂志 2021 年 44卷 6期
标签:
大肠杆菌 卡巴配能类 谱学 傅里叶变换红外 序列同源性 Escherichia coli Carbapenems Spectroscopy Fourier transform infrared Sequence homology
目的:评估傅里叶红外光谱技术(FTIR)对临床分离的碳青霉烯耐药大肠埃希菌(CREC)同源性分析的能力。方法:26株CREC为2018年从来自全国9个省、市(湖南、吉林、浙江、福建、上海、安徽、重庆、云南、河南)的样本中分离,FTIR检测菌株在900~1 200 cm -1区域的红外吸收光谱,使用欧式距离和平均连接聚类方法进行多变量分析;并对菌株进行全基因组测序(WGS)分析单核苷酸多态性(SNP)。 结果:FTIR将26株CREC分为14个红外光谱(IR)型,且相同IR型的菌株均属于同一序列(ST)型。相比WGS对CREC的聚类分析,FTIR的聚类分析结果一致性为92.3