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目的 探讨IFNγ基因的标签单核苷酸多态性(Tag single nucleotide polymorphisms,Tag SNPs)与云南省西双版纳地区傣族、哈尼族人群乙肝病毒(Hepatitis B virus,HBV)感染的相关性.方法 采集傣族、哈尼族人群血样共600份,其中每个民族包含健康对照100名、HBV感染患者200例(包括100例HBV自限性恢复患者以及100例慢性乙型肝炎患者),应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI)对IFNγ基因的3个Tag SNPs(rs1861494、rs2069727和rs2069705)进行基因分型并构建单体型.结果 在傣族和哈尼族人群中,HBV感染组rs1861494位点CC基因型分布频率显著高于正常对照组(傣族:x2=10.017,P=0.001;哈尼族:x2 =6.515,P=0.039),在C隐性的模式下(CC/TC+TT),HBV感染组与正常对照组差异有统计学意义(傣族:P=0.035,OR=9.567,95%CI:1.166~78.499;哈尼族:P=0.027,OR=5.484,95%CI:1.216~24.726).在傣族人群中,慢性乙肝组rs2069705位点CC基因型和C等位基因分布频率显著高于自限性恢复组(基因型:x2 =8.112,P=0.017;等位基因:x2=4.066,P=0.044),在C隐性模式下(CC/CT+TT),慢性乙肝组与自限性恢复组差异有统计学意义(P=0.005,OR=2.295,95%CI:I.281~4.1

作者:高建梅;刘华兴;王金丽;左荣霞;严新民

来源:中华医学遗传学杂志 2015 年 32卷 3期

知识库介绍

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作者:
高建梅;刘华兴;王金丽;左荣霞;严新民
来源:
中华医学遗传学杂志 2015 年 32卷 3期
标签:
干扰素γ 标签单核苷酸多态性 单体型 乙型肝炎病毒 Interferon gamma Tag single nucleotide polymorphisms Haplotype Hepatitis B virus
目的 探讨IFNγ基因的标签单核苷酸多态性(Tag single nucleotide polymorphisms,Tag SNPs)与云南省西双版纳地区傣族、哈尼族人群乙肝病毒(Hepatitis B virus,HBV)感染的相关性.方法 采集傣族、哈尼族人群血样共600份,其中每个民族包含健康对照100名、HBV感染患者200例(包括100例HBV自限性恢复患者以及100例慢性乙型肝炎患者),应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI)对IFNγ基因的3个Tag SNPs(rs1861494、rs2069727和rs2069705)进行基因分型并构建单体型.结果 在傣族和哈尼族人群中,HBV感染组rs1861494位点CC基因型分布频率显著高于正常对照组(傣族:x2=10.017,P=0.001;哈尼族:x2 =6.515,P=0.039),在C隐性的模式下(CC/TC+TT),HBV感染组与正常对照组差异有统计学意义(傣族:P=0.035,OR=9.567,95%CI:1.166~78.499;哈尼族:P=0.027,OR=5.484,95%CI:1.216~24.726).在傣族人群中,慢性乙肝组rs2069705位点CC基因型和C等位基因分布频率显著高于自限性恢复组(基因型:x2 =8.112,P=0.017;等位基因:x2=4.066,P=0.044),在C隐性模式下(CC/CT+TT),慢性乙肝组与自限性恢复组差异有统计学意义(P=0.005,OR=2.295,95%CI:I.281~4.1