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目的:通过网络药理学和分子对接技术探讨雷公藤卵巢毒性的作用机制.方法:通过中药系统药理数据库及分析平台(TCMSP)和比较毒理基因组学数据库(CTD)收集雷公藤的候选毒性化合物和靶点,从CTD中获得雷公藤潜在的卵巢毒性靶点,并利用STRING数据库对雷公藤卵巢毒性的靶点基因进行分析.用Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,用cytoHubba插件鉴定核心基因.此外,利用R软件对雷公藤卵巢毒性的靶点基因进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.最后,使用Discovery Studio软件对核心毒性化合物和核心基因进行分子对接验证.结果:共获得9个雷公藤候选毒性化合物和56个潜在的卵巢毒性靶点.网络分析结果,雷公藤甲素、山柰酚和雷公藤红素是雷公藤的关键卵巢毒性化合物,核心卵巢毒性基因包括TP53、MYC、PTEN、MAPK3、MTOR、STAT3、EGFR、KRAS、CDH1和AKT1.GO和KEGG分析显示,雷公藤通过氧化应激、生殖系统发育和功能、细胞周期调节、对内源性激素和外源性刺激的反应、细胞凋亡调节、衰老等途径引起卵巢毒性.分子对接研究显示,雷公藤的3个关键卵巢毒性化合物可与10个核心基因的对接口袋相匹配.结论:雷公藤可能通过作用于10个核心基因和140条信号通路而导致卵巢毒性.

作者:王志强;宫彩霞;李振彬

来源:浙江大学学报(医学版) 2022 年 51卷 1期

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作者:
王志强;宫彩霞;李振彬
来源:
浙江大学学报(医学版) 2022 年 51卷 1期
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雷公藤 卵巢毒性 网络药理学 靶点 通路
目的:通过网络药理学和分子对接技术探讨雷公藤卵巢毒性的作用机制.方法:通过中药系统药理数据库及分析平台(TCMSP)和比较毒理基因组学数据库(CTD)收集雷公藤的候选毒性化合物和靶点,从CTD中获得雷公藤潜在的卵巢毒性靶点,并利用STRING数据库对雷公藤卵巢毒性的靶点基因进行分析.用Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,用cytoHubba插件鉴定核心基因.此外,利用R软件对雷公藤卵巢毒性的靶点基因进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.最后,使用Discovery Studio软件对核心毒性化合物和核心基因进行分子对接验证.结果:共获得9个雷公藤候选毒性化合物和56个潜在的卵巢毒性靶点.网络分析结果,雷公藤甲素、山柰酚和雷公藤红素是雷公藤的关键卵巢毒性化合物,核心卵巢毒性基因包括TP53、MYC、PTEN、MAPK3、MTOR、STAT3、EGFR、KRAS、CDH1和AKT1.GO和KEGG分析显示,雷公藤通过氧化应激、生殖系统发育和功能、细胞周期调节、对内源性激素和外源性刺激的反应、细胞凋亡调节、衰老等途径引起卵巢毒性.分子对接研究显示,雷公藤的3个关键卵巢毒性化合物可与10个核心基因的对接口袋相匹配.结论:雷公藤可能通过作用于10个核心基因和140条信号通路而导致卵巢毒性.