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目的:探索肝细胞癌模型鼠肠道微生态特征.方法:将2周龄C57BL/6雄鼠分为正常对照组和肝癌模型组.肝癌模型组在出生后2周给予单次腹腔注射二乙基亚硝胺(DEN),其中存活小鼠自4周龄起腹腔注射1,4-双[2-(3,5-二氯吡啶氧)]苯,每2周一次,共8次.分别于小鼠出生后第10、18和32周随机处死部分实验动物,取肝脏进行组织病理学检查.其中,在小鼠出生后第32周处死动物前无菌条件下收集两组粪便标本,并进行V3~V4高可变区16S rRNA基因组测序,进而对菌群多样性、物种丰度差异、菌群相关性、表型预测以及功能预测进行分析.结果:α多样性分析结果显示Good's coverage均已达到最大值1.00,且正常对照组与肝癌模型组肠道菌群Observed features、Chao1指数、Shannon指数和Simpson指数差异均有统计学意义(均P<0.05).β多样性分析结果显示基于加权或未加权Unifrac距离的主坐标PCoA均R>0,标本的组内差异小于组间差异;两组标本的分离趋势明显(P<0.05).拟杆菌门、厚壁菌门、放线菌门及髌骨菌门等菌群为正常对照组与肝癌模型组门水平的优势菌群,但肝癌模型组较正常对照组拟杆菌门丰度显著减少(P<0.01),而髌骨菌门丰度显著增加(P<0.05).正常对照组属水平的优势菌群主要为鼠杆菌科未分类属、副鼠杆菌属、鼠杆菌属、毛螺旋菌科NK4A136属、

作者:周文斌;郑越;尚佳;王海洋;王依莎;陆欢;王小西;隋梅花

来源:浙江大学学报(医学版) 2022 年 51卷 4期

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作者:
周文斌;郑越;尚佳;王海洋;王依莎;陆欢;王小西;隋梅花
来源:
浙江大学学报(医学版) 2022 年 51卷 4期
标签:
肝细胞癌 肠道菌群 物种多样性 菌群构成 16S核糖体RNA测序 二乙基亚硝胺 C57BL/6小鼠
目的:探索肝细胞癌模型鼠肠道微生态特征.方法:将2周龄C57BL/6雄鼠分为正常对照组和肝癌模型组.肝癌模型组在出生后2周给予单次腹腔注射二乙基亚硝胺(DEN),其中存活小鼠自4周龄起腹腔注射1,4-双[2-(3,5-二氯吡啶氧)]苯,每2周一次,共8次.分别于小鼠出生后第10、18和32周随机处死部分实验动物,取肝脏进行组织病理学检查.其中,在小鼠出生后第32周处死动物前无菌条件下收集两组粪便标本,并进行V3~V4高可变区16S rRNA基因组测序,进而对菌群多样性、物种丰度差异、菌群相关性、表型预测以及功能预测进行分析.结果:α多样性分析结果显示Good's coverage均已达到最大值1.00,且正常对照组与肝癌模型组肠道菌群Observed features、Chao1指数、Shannon指数和Simpson指数差异均有统计学意义(均P<0.05).β多样性分析结果显示基于加权或未加权Unifrac距离的主坐标PCoA均R>0,标本的组内差异小于组间差异;两组标本的分离趋势明显(P<0.05).拟杆菌门、厚壁菌门、放线菌门及髌骨菌门等菌群为正常对照组与肝癌模型组门水平的优势菌群,但肝癌模型组较正常对照组拟杆菌门丰度显著减少(P<0.01),而髌骨菌门丰度显著增加(P<0.05).正常对照组属水平的优势菌群主要为鼠杆菌科未分类属、副鼠杆菌属、鼠杆菌属、毛螺旋菌科NK4A136属、