目的 应用生物信息学分析挖掘环境内分泌干扰物(EDCs)对子宫内膜异位症(EMS)的潜在作用.方法 在毒物基因组学数据库(CTD)数据库分别检索双酚A(BPA)、四氯二苯并对二恶英(TCDD)、邻苯二甲酸二酯(DEHP),并在其关联疾病中找到"Endometriosis",下载具有相关性的基因;使用Venn图网络工具选取公共作用基因;使用富集分析数据库(DAVID)对公共作用基因进行基因功能注释(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析;利用STRING数据库建立蛋白质互作网络(PPI);通过Cytoscape软件对PPI进行可视化并筛选核心基因.结果 最终确定25个公共作用基因.GO分析提示,这些公共作用基因主要富集于对遗传信息的调控,以及受体和信号的转导等功能;KEGG分析提示,这些公共作用基因主要富集于甲状腺激素信号通路、催乳素信号通路、卵巢类固醇合成、MAPK信号通路和雌激素信号通路.通过STRING数据库及Cytoscape软件共筛选出原癌基因(FOS)、糖皮质激素受体(NR3C1)、表皮生长因子受体(EGFR)、雌激素受体β(ESR2)、类固醇受体共激活剂(NCOA1)和前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)6种在该网络中连接度最强的基因.结论 FOS、NR3C1、EGFR、ESR2、NCOA1和PTGS2可能是EDCs作用的共同靶点,在EMS发生、发展中起重要作用,并可能成为EMS早期诊断的生物
作者:李楠;陈蕾;张琨
来源:浙江医学 2022 年 44卷 6期