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[目的]利用网络药理学分析调经汤与克罗米芬治疗卵巢早衰(premature ovarian failure,POF)的机制差异,探讨调经汤治疗POF的可能机制.[方法]利用京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)DRUG数据库、中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Database and Analysis Platform,TCMSP)挖掘克罗米芬的分子结构及调经汤潜在活性成分与药物靶点,通过人类基因数据库(Human Gene Database,GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)、药物基因组学知识库(Pharmacogenomics Knowledgebase,PharmGKB),筛选POF的相关疾病靶点.将得到的药物靶点与疾病靶点进行匹配,得到药物-疾病交集靶点数据库,利用Cytoscape 3.8.0软件构建中药成分-靶点-疾病网络.使用STRING网站对得到的交集靶点进行蛋白互作分析,利用R语言进行基因本体(gene oncology,GO)分析和KEGG富集分析.[结果]克罗米芬的靶蛋白为雌激素受体,KEGG通路为雌激素信号通路.调经汤中共筛选出181个活性成分和2873个潜在靶点,POF靶点4597个.通过比对调经汤和POF的共同靶点,筛选出192个关键基因.这些共同靶点涉及的生物学过程主要是氧化物及氧化应激的反应、细胞对化学物

作者:刘希萍;刘佳俐;陈学奇;吴夏秋

来源:浙江中医药大学学报 2022 年 46卷 6期

知识库介绍

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作者:
刘希萍;刘佳俐;陈学奇;吴夏秋
来源:
浙江中医药大学学报 2022 年 46卷 6期
标签:
调经汤 克罗米芬 卵巢早衰 网络药理学 生物信息学 机制
[目的]利用网络药理学分析调经汤与克罗米芬治疗卵巢早衰(premature ovarian failure,POF)的机制差异,探讨调经汤治疗POF的可能机制.[方法]利用京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)DRUG数据库、中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Database and Analysis Platform,TCMSP)挖掘克罗米芬的分子结构及调经汤潜在活性成分与药物靶点,通过人类基因数据库(Human Gene Database,GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)、药物基因组学知识库(Pharmacogenomics Knowledgebase,PharmGKB),筛选POF的相关疾病靶点.将得到的药物靶点与疾病靶点进行匹配,得到药物-疾病交集靶点数据库,利用Cytoscape 3.8.0软件构建中药成分-靶点-疾病网络.使用STRING网站对得到的交集靶点进行蛋白互作分析,利用R语言进行基因本体(gene oncology,GO)分析和KEGG富集分析.[结果]克罗米芬的靶蛋白为雌激素受体,KEGG通路为雌激素信号通路.调经汤中共筛选出181个活性成分和2873个潜在靶点,POF靶点4597个.通过比对调经汤和POF的共同靶点,筛选出192个关键基因.这些共同靶点涉及的生物学过程主要是氧化物及氧化应激的反应、细胞对化学物