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[目的]基于网络药理学和分子对接方法,挖掘姚乃礼教授健脾祛湿解毒通络方治疗幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)感染的作用机制.[方法]应用中药系统药理学分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology,TCMSP),检索并获取健脾祛湿解毒通络方药物的活性成分及靶点,通过人类孟德尔遗传在线(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)、人类基因综合数据库(Human Gene Comprehensive Database,GeneCards)和DrugBank数据库获取Hp感染相关靶点,对药物靶点与疾病靶点取交集,作为健脾祛湿解毒通络方治疗Hp感染的潜在作用靶点.采用Cytoscape 3.7.0软件构建药物-成分-共有靶点网络,通过STRING网站构建蛋白互作(protein protein interaction,PPI)网络,通过Metascape平台进行基因本体(gene ontology,GO)分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析.利用AutoDock软件,对核心靶点和度值前5位的主要活性成分进行分子对接.[结果]健脾祛湿解毒通络方治疗Hp感染有126个靶点,涉及118个活性成分,Cytoscape 3.7.0软件筛选出槲皮素、β-谷甾醇、金合欢素、山柰酚、豆甾醇等主要活性成分,PPI网络分析后得到肿瘤蛋白P53(tumor protein p53,TP53)、信号转导和

作者:田志华;丁媛;王少丽;李萌;陈丁铭;罗楠;周铃;刘震

来源:浙江中医药大学学报 2023 年 47卷 10期

知识库介绍

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作者:
田志华;丁媛;王少丽;李萌;陈丁铭;罗楠;周铃;刘震
来源:
浙江中医药大学学报 2023 年 47卷 10期
标签:
健脾祛湿解毒通络方 幽门螺杆菌感染 网络药理学 分子对接 槲皮素 信号通路 姚乃礼 Jianpi Qushi Jiedu Tongluo Decoction Helicobacter pylori infection network pharmacology molecular docking quercetin signaling pathway YAO Naili
[目的]基于网络药理学和分子对接方法,挖掘姚乃礼教授健脾祛湿解毒通络方治疗幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)感染的作用机制.[方法]应用中药系统药理学分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology,TCMSP),检索并获取健脾祛湿解毒通络方药物的活性成分及靶点,通过人类孟德尔遗传在线(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)、人类基因综合数据库(Human Gene Comprehensive Database,GeneCards)和DrugBank数据库获取Hp感染相关靶点,对药物靶点与疾病靶点取交集,作为健脾祛湿解毒通络方治疗Hp感染的潜在作用靶点.采用Cytoscape 3.7.0软件构建药物-成分-共有靶点网络,通过STRING网站构建蛋白互作(protein protein interaction,PPI)网络,通过Metascape平台进行基因本体(gene ontology,GO)分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析.利用AutoDock软件,对核心靶点和度值前5位的主要活性成分进行分子对接.[结果]健脾祛湿解毒通络方治疗Hp感染有126个靶点,涉及118个活性成分,Cytoscape 3.7.0软件筛选出槲皮素、β-谷甾醇、金合欢素、山柰酚、豆甾醇等主要活性成分,PPI网络分析后得到肿瘤蛋白P53(tumor protein p53,TP53)、信号转导和