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目的 通过肺癌基因表达谱分析与肺癌相关的化疗药物,探讨化疗药物与肺癌基因表达异常的相关性.方法 首先通过统计学方法比较肺癌组织以及正常肺组织的表达谱数据,筛选出这两类组织的差异表达基因.明确肺癌组织基因的异常表达情况.然后通过差异表达基因与药物的关联分析,筛选肺癌组织中上调的差异表达基因所对应的化疗药物,最后筛选能够与多个化疗药物均相对应的基因,对这些基因进行网络调控分析,明确这些基因间的可能调控关系.结果 筛选出在肺癌组织中表达上调的异常表达基因共397个,对应的常用化疗药物有6种,其中TOP2A、MAD2L1、BIRC5这三种基因对应着多个化疗药物,且MAD2L1可能通过P53直接或间接调控TOP2A和BIRC5的生物学功能.结论 肺癌组织中表达上调的基因TOP2A,MAD2L1,BIRC5与肺癌的化疗效果可能有一定相关性,MAD2L1可能影响TOP2A,BIRC5的生物学功能.

作者:齐鲁;丁彦青

来源:肿瘤防治研究 2014 年 41卷 5期

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作者:
齐鲁;丁彦青
来源:
肿瘤防治研究 2014 年 41卷 5期
标签:
肺癌 生物信息学 筛选 化疗药物 Lung cancer Bioinformatics Screen Chemotherapy drugs
目的 通过肺癌基因表达谱分析与肺癌相关的化疗药物,探讨化疗药物与肺癌基因表达异常的相关性.方法 首先通过统计学方法比较肺癌组织以及正常肺组织的表达谱数据,筛选出这两类组织的差异表达基因.明确肺癌组织基因的异常表达情况.然后通过差异表达基因与药物的关联分析,筛选肺癌组织中上调的差异表达基因所对应的化疗药物,最后筛选能够与多个化疗药物均相对应的基因,对这些基因进行网络调控分析,明确这些基因间的可能调控关系.结果 筛选出在肺癌组织中表达上调的异常表达基因共397个,对应的常用化疗药物有6种,其中TOP2A、MAD2L1、BIRC5这三种基因对应着多个化疗药物,且MAD2L1可能通过P53直接或间接调控TOP2A和BIRC5的生物学功能.结论 肺癌组织中表达上调的基因TOP2A,MAD2L1,BIRC5与肺癌的化疗效果可能有一定相关性,MAD2L1可能影响TOP2A,BIRC5的生物学功能.