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目的 筛选体外培养的肝癌SMMC-7721细胞在抵御不同应激原而恶性增殖的过程中,与应激反应密切相关的基因.方法 常规体外培养肝癌SMMC-7721细胞,将处于对数生长期的细胞分为正常组、G418组和氯化钙组,除正常组外,其余两组分别采用G418、氯化钙加以干预,于72和4h后收集各组肝癌细胞,抽提总RNA,使用GeneAtlas基因芯片系统,制作Affymetrix Human Gene 1.1 ST Array Strip表达谱芯片,采用iterPlier法计算基因表达读数计算值,并进行统计学处理,观察与肝癌细胞应激反应相关的基因群的差异性表达特征,通过qRT-PCR检测各基因的相对表达量,对芯片结果加以验证.结果 芯片检测筛选到53个表达量大、且在G418和氯化钙作用下表达量变化较一致的基因;qRT-PCR验证的53个应激相关基因中,17个基因与基因芯片结果完全吻合.结论 在肝癌SMMC-7721细胞抵御G418和氯化钙应激的过程中,作用较关键且在基因芯片和qRT-PCR检测中变化趋势较一致的应激相关基因共有17个.

作者:张园园;方肇勤;梁超

来源:肿瘤防治研究 2016 年 43卷 6期

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作者:
张园园;方肇勤;梁超
来源:
肿瘤防治研究 2016 年 43卷 6期
标签:
肝癌细胞 应激基因 基因芯片 qRT-PCR Hepatocellular carcinoma cells Stress-related genes Genechip qRT-PCR
目的 筛选体外培养的肝癌SMMC-7721细胞在抵御不同应激原而恶性增殖的过程中,与应激反应密切相关的基因.方法 常规体外培养肝癌SMMC-7721细胞,将处于对数生长期的细胞分为正常组、G418组和氯化钙组,除正常组外,其余两组分别采用G418、氯化钙加以干预,于72和4h后收集各组肝癌细胞,抽提总RNA,使用GeneAtlas基因芯片系统,制作Affymetrix Human Gene 1.1 ST Array Strip表达谱芯片,采用iterPlier法计算基因表达读数计算值,并进行统计学处理,观察与肝癌细胞应激反应相关的基因群的差异性表达特征,通过qRT-PCR检测各基因的相对表达量,对芯片结果加以验证.结果 芯片检测筛选到53个表达量大、且在G418和氯化钙作用下表达量变化较一致的基因;qRT-PCR验证的53个应激相关基因中,17个基因与基因芯片结果完全吻合.结论 在肝癌SMMC-7721细胞抵御G418和氯化钙应激的过程中,作用较关键且在基因芯片和qRT-PCR检测中变化趋势较一致的应激相关基因共有17个.