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芸薹属作物是十字花科中重要的蔬菜和油用作物,经济价值和食用价值比较高.本研究通过生物信息学手段,从3个芸薹属物种EST序列中获得了大量的SNP和Indel资源,对SNP与EST的数量及拼接结果之间的关系、SNP碱基置换的偏好性、Indel碱基数量与发生频率之间的关系进行了分析.分析结果对深入研究芸薹属基因组特点具有一定的参考价值,为进一步通过试验验证预测的SNP位点、开发该作物高通量SNP分子标记奠定了基础.

作者:李雪姣;张耿;顾爱侠;轩淑欣;王彦华;赵建军

来源:植物遗传资源学报 2010 年 11卷 6期

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作者:
李雪姣;张耿;顾爱侠;轩淑欣;王彦华;赵建军
来源:
植物遗传资源学报 2010 年 11卷 6期
标签:
芸薹属 序列表达标签(EST) 单核苷酸多态性(SNP) 分子标记
芸薹属作物是十字花科中重要的蔬菜和油用作物,经济价值和食用价值比较高.本研究通过生物信息学手段,从3个芸薹属物种EST序列中获得了大量的SNP和Indel资源,对SNP与EST的数量及拼接结果之间的关系、SNP碱基置换的偏好性、Indel碱基数量与发生频率之间的关系进行了分析.分析结果对深入研究芸薹属基因组特点具有一定的参考价值,为进一步通过试验验证预测的SNP位点、开发该作物高通量SNP分子标记奠定了基础.