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目的 基于网络药理学研究槲皮素治疗冠心病的分子机制.方法 通过TCMSP、Swiss Target Prediction和Pharm Mapper数据库,收集槲皮素的潜在靶点,使用DisGeNET和GeneCards数据库查询冠心病的相关靶点,通过构建Venn图,得到槲皮素-冠心病共同靶点.运用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,Cytoscape 3.7.2软件的cytoHubba插件对PPI网络进行分析,得到槲皮素治疗冠心病的关键靶点.通过Metascape数据库对共同靶点进行GO和KEGG通路富集分析,并使用Auto Dock Vina软件进行分子对接.结果 共得到233个槲皮素-冠心病共同靶点,筛选出5个核心靶点:丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、肿瘤抑制蛋白P53(TP53)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、白介素-6(IL-6)、血管内皮生长因子A(VEGFA).GO分析中,生物学过程主要与创伤反应、脂多糖反应、凋亡信号通路、有毒物质反应、细胞运动正调节相关.KEGG通路分析主要富集在癌症、糖尿病并发症AGE-RAGE信号通路、MAPK信号通路、HIF-1信号通路、铂耐药等.分子对接的平均对接亲和力为-7.9 kcal/mol,提示结合活性较好.结论 槲皮素治疗冠心病的机制具有多靶点、多通路特点,为后续的基础研究提供了思路.

作者:徐江林;林谦;刘静;万洁;崔晓云;纪翔;毛天诗;张卓;逯金金

来源:中西医结合心脑血管病杂志 2020 年 18卷 24期

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作者:
徐江林;林谦;刘静;万洁;崔晓云;纪翔;毛天诗;张卓;逯金金
来源:
中西医结合心脑血管病杂志 2020 年 18卷 24期
标签:
冠心病 槲皮素 网络药理学 分子对接
目的 基于网络药理学研究槲皮素治疗冠心病的分子机制.方法 通过TCMSP、Swiss Target Prediction和Pharm Mapper数据库,收集槲皮素的潜在靶点,使用DisGeNET和GeneCards数据库查询冠心病的相关靶点,通过构建Venn图,得到槲皮素-冠心病共同靶点.运用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,Cytoscape 3.7.2软件的cytoHubba插件对PPI网络进行分析,得到槲皮素治疗冠心病的关键靶点.通过Metascape数据库对共同靶点进行GO和KEGG通路富集分析,并使用Auto Dock Vina软件进行分子对接.结果 共得到233个槲皮素-冠心病共同靶点,筛选出5个核心靶点:丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、肿瘤抑制蛋白P53(TP53)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、白介素-6(IL-6)、血管内皮生长因子A(VEGFA).GO分析中,生物学过程主要与创伤反应、脂多糖反应、凋亡信号通路、有毒物质反应、细胞运动正调节相关.KEGG通路分析主要富集在癌症、糖尿病并发症AGE-RAGE信号通路、MAPK信号通路、HIF-1信号通路、铂耐药等.分子对接的平均对接亲和力为-7.9 kcal/mol,提示结合活性较好.结论 槲皮素治疗冠心病的机制具有多靶点、多通路特点,为后续的基础研究提供了思路.