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目的 通过网络药理学和分子对接技术探讨三七治疗心房颤动的分子机制.方法 采用中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选三七活性成分及靶点,利用Cytoscape 3.7.2软件构建活性成分-预测靶点网络.通过OMIM、DrugBank、GeneCards、DisGeNET数据库检索心房颤动相关靶点,利用STRING 11.0构建交集靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,通过Cytoscape 3.7.2软件进行可视化分析.利用Metascape平台对交集靶点进行基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,借助Cytoscape 3.7.2软件构建三七活性成分-靶点-信号通路网络图,利用AutoDock软件进行分子对接并通过Pymol对结果进行可视化处理.结果 筛选出三七活性成分9个,三七-心房颤动交集靶点102个.GO分析主要得到6个生物学过程、4种分子功能和4条细胞组分表达过程,KEGG分析得到显著相关信号通路20条(P<0.01),主要涉及晚期糖基化产物-受体(AGE-RAGE)信号通路、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、白细胞介素17(IL-17)信号通路等.分子对接得分均小于-6.0.结论 初步揭示三七可从细胞、组织、器官、代谢、免疫、炎症、凋亡、氧化应激、离子通道等多方面治疗心房颤动,为后续

作者:陶诗怡;于林童;朱春临;张瑾;张兰鑫;黄力

来源:中西医结合心脑血管病杂志 2021 年 19卷 22期

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作者:
陶诗怡;于林童;朱春临;张瑾;张兰鑫;黄力
来源:
中西医结合心脑血管病杂志 2021 年 19卷 22期
标签:
心房颤动;三七;网络药理学;分子对接;作用机制;成分-靶点-通路
目的 通过网络药理学和分子对接技术探讨三七治疗心房颤动的分子机制.方法 采用中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选三七活性成分及靶点,利用Cytoscape 3.7.2软件构建活性成分-预测靶点网络.通过OMIM、DrugBank、GeneCards、DisGeNET数据库检索心房颤动相关靶点,利用STRING 11.0构建交集靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,通过Cytoscape 3.7.2软件进行可视化分析.利用Metascape平台对交集靶点进行基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,借助Cytoscape 3.7.2软件构建三七活性成分-靶点-信号通路网络图,利用AutoDock软件进行分子对接并通过Pymol对结果进行可视化处理.结果 筛选出三七活性成分9个,三七-心房颤动交集靶点102个.GO分析主要得到6个生物学过程、4种分子功能和4条细胞组分表达过程,KEGG分析得到显著相关信号通路20条(P<0.01),主要涉及晚期糖基化产物-受体(AGE-RAGE)信号通路、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、白细胞介素17(IL-17)信号通路等.分子对接得分均小于-6.0.结论 初步揭示三七可从细胞、组织、器官、代谢、免疫、炎症、凋亡、氧化应激、离子通道等多方面治疗心房颤动,为后续