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目的:采用网络药理学和分子对接探讨丹参抗放射性心肌纤维化的分子机制.方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)进行药物成分和相应靶点筛选,疾病靶点通过基因名片数据库(GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)和治疗靶点数据库(TTD)获得,在 Venny 2.1.0 平台上提取二者共同靶点.运用 STRING 数据库与 Cytoscype 3.9.1 软件建立蛋白互作(PPI)网络,对 PPI网络行拓扑学分析得到的核心靶点导入 Metascape数据库进行功能富集分析,经 Cytoscype 3.9.1 软件构建"活性成分-核心靶点-信号通路"网络.最后,利用 AutoDockTools 1.5.6软件进行分子对接验证,可视化由 PyMOL 2.2.0 软件完成.结果:共获取药物活性成分 59种,相应靶点 137 个,疾病靶点 3042 个,交集靶点 100 个.PPI网络拓扑学分析所得的蛋白激酶 B1(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)、肿瘤蛋白 p53(TP53)等 22个核心靶点,主要通过 TNF信号通路、缺氧诱导因子 1(HIF-1)信号通路、丝裂原激活蛋白激酶(MAPK)信号通路等途径发挥功能,与丹参中毛地黄黄酮、丹参酮ⅡA、2-异丙基-8-甲基菲-3,4-二酮等活性成分有关.分子对接结果显示,核心靶点与核心成分间结合紧密,结构稳定.结论:丹参治疗放射性心肌纤维化具有多成分、多靶点、多通路的特点,可为今后临床应用

作者:黄愿;万敬强;马永霞;鄢文婷;谢萍

来源:中西医结合心脑血管病杂志 2023 年 21卷 14期

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作者:
黄愿;万敬强;马永霞;鄢文婷;谢萍
来源:
中西医结合心脑血管病杂志 2023 年 21卷 14期
标签:
放射性心肌纤维化 丹参 网络药理学 分子对接 机制 radiatione-induced myocardial fibrosis Salvia miltiorrhiza network pharmacology molecular docking mechanism
目的:采用网络药理学和分子对接探讨丹参抗放射性心肌纤维化的分子机制.方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)进行药物成分和相应靶点筛选,疾病靶点通过基因名片数据库(GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)和治疗靶点数据库(TTD)获得,在 Venny 2.1.0 平台上提取二者共同靶点.运用 STRING 数据库与 Cytoscype 3.9.1 软件建立蛋白互作(PPI)网络,对 PPI网络行拓扑学分析得到的核心靶点导入 Metascape数据库进行功能富集分析,经 Cytoscype 3.9.1 软件构建"活性成分-核心靶点-信号通路"网络.最后,利用 AutoDockTools 1.5.6软件进行分子对接验证,可视化由 PyMOL 2.2.0 软件完成.结果:共获取药物活性成分 59种,相应靶点 137 个,疾病靶点 3042 个,交集靶点 100 个.PPI网络拓扑学分析所得的蛋白激酶 B1(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)、肿瘤蛋白 p53(TP53)等 22个核心靶点,主要通过 TNF信号通路、缺氧诱导因子 1(HIF-1)信号通路、丝裂原激活蛋白激酶(MAPK)信号通路等途径发挥功能,与丹参中毛地黄黄酮、丹参酮ⅡA、2-异丙基-8-甲基菲-3,4-二酮等活性成分有关.分子对接结果显示,核心靶点与核心成分间结合紧密,结构稳定.结论:丹参治疗放射性心肌纤维化具有多成分、多靶点、多通路的特点,可为今后临床应用