目的:利用生物信息学技术分析急性心肌梗死后心力衰竭(HFpAMI)的差异表达基因(DEGs),并对干预 DEGs的中药进行预测,为深入探索 HFpAMI 相关作用机制及干预中药的用药规律提供科学依据.方法:从基因表达综合数据库(GEO)中获取GSE59867数据集中有关急性心肌梗死后的心力衰竭(HF)和非心力衰竭样本;利用 Limma包筛选两组样本间的 DEGs,通过基于本体的医学信息检索平台(Coremine Medical)数据库预测干预 DEGs的中药,收集其性味归经及功效等信息.利用 WGCNA获取与临床性状相关性最高的基因模块,再与 DEGs取交集后获得次 Hub基因,构建次 Hub基因的蛋白互作网络并进行模块分析,筛选Hub基因,并对单个 Hub基因进行基因集富集分析(GSEA).结果:共鉴定出 140 个 DEGs和 10 个 Hub基因,10 个 Hub基因为分化抗原 28(CD28)、原癌基因 c-Fos(FOS)、白细胞介素-2 受体α亚型(IL2RA)、B淋巴细胞抗原 CD20(MS4A1)、Rho相关 GTP结合蛋白(RHOH)、分化抗原 24(CD24)、假定 P2Y嘌呤受体 10(P2RY10)、二肽基肽酶 4(DPP4)、血小板反应蛋白-1(THBS1)、2 型补体受体(CR2).GSEA共发现 19条信号通路,涉及免疫损伤和炎症介导的多个生物学过程及信号通路,其中以补体及凝血级联最为关键.中药预测结果显示:潜在干预 HFpAMI的中药药性多为性温
作者:乔利杰;王建茹;李彬;朱明军
来源:中西医结合心脑血管病杂志 2023 年 21卷 17期