目的:借助网络药理学分析,联合分子对接及基因表达芯片分析验证,探讨银杏叶-葶苈子延缓心肌纤维化的作用机制.方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台筛选银杏叶-葶苈子的有效成分和靶点,通过人类基因数据库(GeneCards)、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)获取心肌纤维化的靶点.将有效成分靶点与心肌纤维化靶点分别导入 Cytoscape 3.8.0 软件构建药物-成分-靶点网络、STRING平台构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,再利用 Cytoscape自带的网络分析工具计算网络拓扑参数,分析获取关键靶点.将交集靶点通过 R软件进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.最后利用基因表达数据库(GEO)的芯片数据进行数据分析,并利用 AutoDock软件进行有效成分与核心靶点分子对接,Pymol软件绘制分子对接模式图验证核心靶点.结果:通过相关数据库,获得药物有效成分 39个,筛选出有效成分作用靶点 116个,心肌纤维化靶点 3 322 个.网络拓扑图分析获得转录因子 P65(RELA)、雄性激素受体(AR)、前列腺素 G/H合酶 1(PTGS1)、肿瘤蛋白质 P53(TP53)、核因子-κB(NF-κB)抑制剂α(NFKBIA)等关键靶点.GO分析主要涉及对化学应激的细胞反应、对类固醇激素反应、DNA结合转录因子结合、核受体活动、泛素蛋白连接酶等过程,KE
作者：黄浩；余广彬；陈丽；顾建豪；洪永敦
来源：中西医结合心脑血管病杂志 2023 年 21卷 23期
