目的:通过网络药理学和分子对接研究柴胡-甘草药对治疗反流性食管炎(Reflux Esophagitis,RE)的作用机制.方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台检索柴胡-甘草药对有效化学成分及相应的作用靶点,在Uniprot数据库获取对应的基因命名,通过Cytoscape软件构建药物-成分-靶点网络图.从GeneCards数据库、Disgenet数据库搜集RE的相关靶点并与柴胡-甘草药对的靶点取交集,用String数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用网络分析.用Cytohubba插件分析得到柴胡-甘草药对治疗RE的核心靶点,再用Cytoscape软件构建活性成分-靶点-疾病网络图.借助Matescape数据库进行基因本体论(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并构建成分-靶点-通路网络图,最后用Autodock软件和Pymol软件对主要活性成分及核心靶点进行分子对接验证和可视化展示.结果:最终筛选得到 91个活性成分作用于73个药物-疾病共同靶点,其中主要活性成分为槲皮素、山柰酚、异鼠李素等,核心靶点为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、肿瘤抑制蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)等.GO富集分析总共富集到 4534 条生物过程、452 个分子功能、320 个细胞组成.KEGG富集分析得到 215 条通路,主要涉及磷脂酰肌醇 3 激酶信号通路、p53
作者:罗萍;吕琳
来源:中医临床研究 2023 年 15卷 17期