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目的:运用网络药理学及分子对接技术研究当归-川芎药对治疗股骨头坏死的多靶点作用机制.方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索当归-川芎的有效成分及其作用靶点;采用GeneCards、OMIM、DrugBank等数据库检索股骨头坏死的疾病靶点;采用Cytoscape 3.9.1 建立化合物-靶点-通路-疾病网络;使用STRING构建蛋白质-蛋白质相互作用网络;应用Metascape库进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;运用IGEMDOCK软件进行分子对接并进行对接效果的打分.结果:当归-川芎药对具有 9 个有效成分,有效成分的基因靶点与股骨头坏死基因靶点的交集基因有 30 个.通过对药物-有效成分-靶点-股骨头坏死调控网络的可视化分析,发现有效成分中的β-谷甾醇及杨梅酮所对应的交集基因最多.运用蛋白质-蛋白质相互作用网络预测到半胱氨酸蛋白酶 3(Caspase 3,CASP3)、转录因子激活蛋白-1亚基(Transcription factor activator protein-1 subunit,JUN)、前列腺素G/H合酶2(Prostaglandin G/H Synthase 2,PTGS2)等 30 个基因是当归-川芎治疗股骨头坏死所干预的重要靶点.富集分析结果分析显示,当归-川芎有效成分在脂代谢相关生物过程、核受体相关分子作用、膜转运相关细胞组分中均可干预股骨

作者:黄克松;郑昊天;高向明;吕子豪

来源:中医临床研究 2023 年 15卷 25期

知识库介绍

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作者:
黄克松;郑昊天;高向明;吕子豪
来源:
中医临床研究 2023 年 15卷 25期
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当归 川芎 股骨头坏死 网络药理学 分子对接 Danggui Chuanxiong Femoral head necrosis Network pharmacology Molecular docking
目的:运用网络药理学及分子对接技术研究当归-川芎药对治疗股骨头坏死的多靶点作用机制.方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索当归-川芎的有效成分及其作用靶点;采用GeneCards、OMIM、DrugBank等数据库检索股骨头坏死的疾病靶点;采用Cytoscape 3.9.1 建立化合物-靶点-通路-疾病网络;使用STRING构建蛋白质-蛋白质相互作用网络;应用Metascape库进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;运用IGEMDOCK软件进行分子对接并进行对接效果的打分.结果:当归-川芎药对具有 9 个有效成分,有效成分的基因靶点与股骨头坏死基因靶点的交集基因有 30 个.通过对药物-有效成分-靶点-股骨头坏死调控网络的可视化分析,发现有效成分中的β-谷甾醇及杨梅酮所对应的交集基因最多.运用蛋白质-蛋白质相互作用网络预测到半胱氨酸蛋白酶 3(Caspase 3,CASP3)、转录因子激活蛋白-1亚基(Transcription factor activator protein-1 subunit,JUN)、前列腺素G/H合酶2(Prostaglandin G/H Synthase 2,PTGS2)等 30 个基因是当归-川芎治疗股骨头坏死所干预的重要靶点.富集分析结果分析显示,当归-川芎有效成分在脂代谢相关生物过程、核受体相关分子作用、膜转运相关细胞组分中均可干预股骨