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目的:通过网络药理学理论及分子对接探究黄芪治疗口腔鳞状细胞癌(Oral Squamous Cell Carcinoma,OSCC)的可能机制.方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)下载黄芪的有效成分及对应靶点,并通过癌症基因组图谱获取OSCC的差异表达基因集,筛选出的共同靶点即为黄芪治疗OSCC的潜在靶点.利用STRING数据库获取潜在靶点的相互作用关系,用Cytoscape软件构建黄芪治疗OSCC的潜在靶点相互作用网络图,并获得关键靶点.通过注释可视化和集成发现数据库(DAVID)和KOBAS数据库分别对潜在靶点进行基因本体论功能和京都基因与基因组百科全书通路富集分析并构建"靶点-信号通路"网络图.借助Schrodinger软件对关键靶点及相应的黄芪有效成分进行分子对接.结果:黄芪可通过66个潜在靶点治疗OSCC,包括周期蛋白依赖激酶1(Cyclin Dependent Kinase 1,CDK1)、信号转导和转录活化因子1(Signal Transducer and Activator of Transcription 1,STAT1)、雄激素受体蛋白(Androgen Receptor,AR)、表皮生长因子受体(Epidermal Growth Factor Receptor,EGFR)和微囊蛋白1(Caveolin-1,CAV1).黄芪治疗OSCC的潜在靶点富集最显著的是肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)信号通路、细胞衰老和p53信号通路.关键靶点AR和黄芪相关有效成分均

作者:吕薇;李翠萍;冯冰华;粟小平;黄旋平

来源:中医临床研究 2023 年 15卷 25期

知识库介绍

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作者:
吕薇;李翠萍;冯冰华;粟小平;黄旋平
来源:
中医临床研究 2023 年 15卷 25期
标签:
网络药理学 口腔鳞状细胞癌 黄芪 蛋白质-蛋白质相互作用网络 分子对接 Network pharmacology Oral squamous cell carcinoma Huangqi Protein-protein interaction network Molecular docking
目的:通过网络药理学理论及分子对接探究黄芪治疗口腔鳞状细胞癌(Oral Squamous Cell Carcinoma,OSCC)的可能机制.方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)下载黄芪的有效成分及对应靶点,并通过癌症基因组图谱获取OSCC的差异表达基因集,筛选出的共同靶点即为黄芪治疗OSCC的潜在靶点.利用STRING数据库获取潜在靶点的相互作用关系,用Cytoscape软件构建黄芪治疗OSCC的潜在靶点相互作用网络图,并获得关键靶点.通过注释可视化和集成发现数据库(DAVID)和KOBAS数据库分别对潜在靶点进行基因本体论功能和京都基因与基因组百科全书通路富集分析并构建"靶点-信号通路"网络图.借助Schrodinger软件对关键靶点及相应的黄芪有效成分进行分子对接.结果:黄芪可通过66个潜在靶点治疗OSCC,包括周期蛋白依赖激酶1(Cyclin Dependent Kinase 1,CDK1)、信号转导和转录活化因子1(Signal Transducer and Activator of Transcription 1,STAT1)、雄激素受体蛋白(Androgen Receptor,AR)、表皮生长因子受体(Epidermal Growth Factor Receptor,EGFR)和微囊蛋白1(Caveolin-1,CAV1).黄芪治疗OSCC的潜在靶点富集最显著的是肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)信号通路、细胞衰老和p53信号通路.关键靶点AR和黄芪相关有效成分均