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目的:通过对肺腺癌的单细胞数据进行分析,着眼于B细胞在肺腺癌发生和发展中的动态变化,刻画B细胞在肺腺癌肿瘤微环境中的作用。方法:对肺腺癌患者的单细胞数据进行分析,使用NormalizeData和ScaleData函数对原始读取计数归一化,消退基因表达的细胞间差异。使用“FindVariableFeatures”计算组间高表达基因。使用SingleR辅助进行细胞类别注释,使用monocle2对10种B细胞亚类细胞进行拟时序分析,差异表达基因进行GO通路富集分析。结果:相对正常肺组织,B细胞在肺癌组织中分布相对较多,其中记忆性B细胞和浆细胞显著增多;而在脑转移组织中,浆细胞显著增多。对各组织的差异基因进行富集分析发现,在肺癌原发灶中免疫B细胞对癌细胞产生强烈的免疫反应;而浆细胞在脑转移瘤中的作用主要是抑制细胞生长、保证细胞和组织的稳定,一定程度上缓解肿瘤细胞入侵其他组织的伤害。结论:基于单细胞分析可以进一步了解B细胞在肺腺癌发生和脑转移过程中的作用机制,对肺腺癌脑转移的免疫临床应用提供理论基础。

作者:李静;孔一茹;葛蒙晰;季笑宇;王清;林浩;王玉;姚蓉蓉;梁晓华;周鑫莉

来源:中华转移性肿瘤杂志 2023 年 06卷 3期

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作者:
李静;孔一茹;葛蒙晰;季笑宇;王清;林浩;王玉;姚蓉蓉;梁晓华;周鑫莉
来源:
中华转移性肿瘤杂志 2023 年 06卷 3期
标签:
肺腺癌 单细胞测序 肿瘤微环境 B细胞 Adenocarcinoma of the lung Single-cell sequencing Tumor microenvironment B cells
目的:通过对肺腺癌的单细胞数据进行分析,着眼于B细胞在肺腺癌发生和发展中的动态变化,刻画B细胞在肺腺癌肿瘤微环境中的作用。方法:对肺腺癌患者的单细胞数据进行分析,使用NormalizeData和ScaleData函数对原始读取计数归一化,消退基因表达的细胞间差异。使用“FindVariableFeatures”计算组间高表达基因。使用SingleR辅助进行细胞类别注释,使用monocle2对10种B细胞亚类细胞进行拟时序分析,差异表达基因进行GO通路富集分析。结果:相对正常肺组织,B细胞在肺癌组织中分布相对较多,其中记忆性B细胞和浆细胞显著增多;而在脑转移组织中,浆细胞显著增多。对各组织的差异基因进行富集分析发现,在肺癌原发灶中免疫B细胞对癌细胞产生强烈的免疫反应;而浆细胞在脑转移瘤中的作用主要是抑制细胞生长、保证细胞和组织的稳定,一定程度上缓解肿瘤细胞入侵其他组织的伤害。结论:基于单细胞分析可以进一步了解B细胞在肺腺癌发生和脑转移过程中的作用机制,对肺腺癌脑转移的免疫临床应用提供理论基础。