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目的:采用网络药理学与分子对接技术探讨银柴胡解热作用的机制.方法:借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中医药整合药理学研究平台(TCMIP)和中药分子机制生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)筛选银柴胡活性成分和相关作用靶点;使用GeneCards、OMIM和TTD数据库筛选发热相关靶点;通过STRING数据库构建活性成分靶点与发热疾病靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;利用Cytoscape软件的Network Analysis插件对获得的PPI网络进行拓扑分析,筛选核心节点;使用Venny软件获得银柴胡活性成分靶点、发热疾病靶点和核心节点的交集靶点,并通过进一步的拓扑分析筛选得到关键成分和关键靶点;通过DAVID数据库进行基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;利用Schr?dinger软件对关键靶点与对应的关键成分进行分子对接.结果:银柴胡解热关键成分为银柴胡胺D和银柴胡新木质素-β-D-葡萄糖苷A~D,71 个关键靶点主要包括促丝裂原活化蛋白激酶 10(MAPK10)、蛋白激酶B1(Akt1)、热休克蛋白 90AA1(HSP90AA1)、细胞周期蛋白依赖性激酶 2(CDK2)、转化蛋白p21(HRAS)、血管内皮生长因子受体 2(KDR)、原癌基因受体酪氨酸激酶(KIT)等;KEGG富集的 67 条通路主要包括Rap1 信号通路、Toll样受体信号通路、肿

作者:宁娱;李振凯;王银洁;谢宝琳;彭励

来源:中国现代中药 2023 年 25卷 5期

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作者:
宁娱;李振凯;王银洁;谢宝琳;彭励
来源:
中国现代中药 2023 年 25卷 5期
标签:
银柴胡 解热 网络药理学 分子对接 作用机制
目的:采用网络药理学与分子对接技术探讨银柴胡解热作用的机制.方法:借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中医药整合药理学研究平台(TCMIP)和中药分子机制生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)筛选银柴胡活性成分和相关作用靶点;使用GeneCards、OMIM和TTD数据库筛选发热相关靶点;通过STRING数据库构建活性成分靶点与发热疾病靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;利用Cytoscape软件的Network Analysis插件对获得的PPI网络进行拓扑分析,筛选核心节点;使用Venny软件获得银柴胡活性成分靶点、发热疾病靶点和核心节点的交集靶点,并通过进一步的拓扑分析筛选得到关键成分和关键靶点;通过DAVID数据库进行基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;利用Schr?dinger软件对关键靶点与对应的关键成分进行分子对接.结果:银柴胡解热关键成分为银柴胡胺D和银柴胡新木质素-β-D-葡萄糖苷A~D,71 个关键靶点主要包括促丝裂原活化蛋白激酶 10(MAPK10)、蛋白激酶B1(Akt1)、热休克蛋白 90AA1(HSP90AA1)、细胞周期蛋白依赖性激酶 2(CDK2)、转化蛋白p21(HRAS)、血管内皮生长因子受体 2(KDR)、原癌基因受体酪氨酸激酶(KIT)等;KEGG富集的 67 条通路主要包括Rap1 信号通路、Toll样受体信号通路、肿