目的 应用生物信息学方法分析激素受体阳性乳腺癌基因芯片数据,筛选内分泌治疗(ET)耐药组与敏感组间差异表达基因(DEGs),探索内分泌治疗耐药可能相关的信号通路.方法 在基因表达汇编(GEO)数据库选取GSE67916、GSE51390基因芯片数据,利用GEO2R分析芯片集ET耐药和敏感组间的DEGs,利用Venn diagram筛选两个芯片集中共同表达的DEGs.通过STRING数据库及Cytoscape 3.8.2软件构建DEGs对应蛋白间的互作网络(PPI),筛选出前20个关键蛋白,应用DAVID数据库对20个关键蛋白对应基因进行GO分析及KEGG分析.应用Kaplan-Meier plotter数据库对20个关键基因进行预后分析,选取本中心乳腺癌ET敏感和耐药患者的病理标本,采用免疫组织化学法(IHC)检查关键DEGs基因相应蛋白的表达,验证蛋白表达情况与ET耐药的关系.结果 从两个芯片集中筛选出共同表达DEGs 184个,其中上调基因68个、下调基因116个.以构建PPI网络分析获得的关联性最强的前20个基因为本研究的主要对象.使用Kaplan-Meier Plotter在线数据库分析20个基因与激素受体阳性乳腺癌无复发生存(Recurrence-free survival,RFS)的关系,结果显示11个基因的表达与乳腺癌RFS相关(P均＜0.05),分别是PTPN11、SDC1、CD24、ITPR1、GATA3、PLCG2、ESR1、PGR、ERBB4、TP53及FGFR2.本中心数

作者：杜松丽；樊莉；陈茂山；周恋；华帮江；杨宏伟

来源：遵义医科大学学报 2023 年 46卷 1期