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撰稿:
陈占国 (温州医科大学附属第二医院)
审稿:
吕建新 (温州医科大学)
t(1;19)(q23;p13) 染色体易位导致形成E2A-PBX1融合基因,它在小儿急性淋巴细胞白血病(ALL)中较常见。t(1;19)易位涉及1号染色体长臂q23的前B白血病1(PBX1)基因和19号染色体短臂p13的免疫球蛋白增强子结合因子(E2A)基因。E2A基因广泛表达于早期B细胞系,在早期B细胞分化发育中发挥重要作用,参与免疫球蛋白基因重排,调节成熟B细胞的Ig类别转换。PBX1基因是一种原癌基因,编码PBX1a和PBX1b两种蛋白,非活化状态时PBX1通过Helix结构与原癌蛋白Hox结合形成三聚体,与DNA结合调控一系列基因的转录表达。在某些特定的情况下,染色体发生断裂融合形成E2A-PBX1融合基因。该融合基因的融合蛋白具有致癌性,然而其具体机制尚不明确。 根据融合基因断裂点的不同,E2A-PBX1融合基因亚型有3种。E2A基因第13外显子和PBX1基因第2外显子连接形成的E2A-PBX1融合基因,是最主要的亚型,还有一种亚型在5%~10%的E2A-PBX1融合基因阳性患者中发现,E2A基因第13外显子和PBX1基因第2外显子的连接点处有27个核苷酸的突变。因此,编码出两种不同的蛋白P85和P77,两者只在PBX1部分的羧基端存在差异,并都具有转化特性,属于癌蛋白。另外,还有1种罕见的E2A-PBX1融合基因亚型,在基因拼接过程中,E2A基因第12外显子选择性被剪切了,E2A基因第11外显子和第13外显子连接,再与PBX1基因第2外显子拼接而形成E2A-PBX1融合基因。在儿童前体B细胞ALL(pre B-ALL)患者中20%~25%可以检测到E2A-PBX1融合基因阳性,也有1%的早期前B细胞ALL为该融合基因阳性。 E2A-PBX1融合基因的主要检测方法有荧光原位杂交技术(FISH)、有定性RT-PCR(电泳法或PCR探针法)和反转录荧光定量PCR方法(RT-qPCR)。FISH方法采用特定的E2A-PBX1探针检测染色体易位,定性RT-PCR方法往往会与多种白血病相关融合基因组合检测,如白血病融合基因筛查定性检测;定量方法有一步法和两步法,一次性检测2种主要的E2A-PBX1融合基因亚型。E2A-PBX1定量计算采用校准化拷贝数(NCN)表示,NCN=(E2A-PBX1的拷贝数/ABL内参基因的拷贝数)×100%。
t(1;19)(q23;p13) 染色体易位导致形成E2A-PBX1融合基因,它在小儿急性淋巴细胞白血病(ALL)中较常见。t(1;19)易位涉及1号染色体长臂q23的前B白血病1(PBX1)基因和19号染色体短臂p13的免疫球蛋白增强子结合因子(E2A)基因。E2A基因广泛表达于早期B细胞系,在早期B细胞分化发育中发挥重要作用,参与免疫球蛋白基因重排,调节成熟B细胞的Ig类别转换。PBX1基因是一种原癌基因,编码PBX1a和PBX1b两种蛋白,非活化状态时PBX1通过Helix结构与原癌蛋白Hox结合形成三聚体,与DNA结合调控一系列基因的转录表达。在某些特定的情况下,染色体发生断裂融合形成E2A-PBX1融合基因。该融合基因的融合蛋白具有致癌性,然而其具体机制尚不明确。 根据融合基因断裂点的不同,E2A-PBX1融合基因亚型有3种。E2A基因第13外显子和PBX1基因第2外显子连接形成的E2A-PBX1融合基因,是最主要的亚型,还有一种亚型在5%~10%的E2A-PBX1融合基因阳性患者中发现,E2A基因第13外显子和PBX1基因第2外显子的连接点处有27个核苷酸的突变。因此,编码出两种不同的蛋白P85和P77,两者只在PBX1部分的羧基端存在差异,并都具有转化特性,属于癌蛋白。另外,还有1种罕见的E2A-PBX1融合基因亚型,在基因拼接过程中,E2A基因第12外显子选择性被剪切了,E2A基因第11外显子和第13外显子连接,再与PBX1基因第2外显子拼接而形成E2A-PBX1融合基因。在儿童前体B细胞ALL(pre B-ALL)患者中20%~25%可以检测到E2A-PBX1融合基因阳性,也有1%的早期前B细胞ALL为该融合基因阳性。 E2A-PBX1融合基因的主要检测方法有荧光原位杂交技术(FISH)、有定性RT-PCR(电泳法或PCR探针法)和反转录荧光定量PCR方法(RT-qPCR)。FISH方法采用特定的E2A-PBX1探针检测染色体易位,定性RT-PCR方法往往会与多种白血病相关融合基因组合检测,如白血病融合基因筛查定性检测;定量方法有一步法和两步法,一次性检测2种主要的E2A-PBX1融合基因亚型。E2A-PBX1定量计算采用校准化拷贝数(NCN)表示,NCN=(E2A-PBX1的拷贝数/ABL内参基因的拷贝数)×100%。
【标准名称】:
白血病融合基因(E2A-PBX1)检测
【英文名称】:
detection for E2A-PBX1 fusion gene of leukemia
【分类】:
肿瘤分子生物学检验
【别名】:
认证专家
撰稿

陈占国 (作者空间)

温州医科大学附属第二医院

审稿

吕建新 (作者空间)

温州医科大学

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